More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4490 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4490  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 511 aa  1018    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  decreased coverage  0.000741245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0868  anti-sigma-factor antagonist  69.45 
 
 		 506 aa  640    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  31.22 
 
 		 521 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  34.27 
 
 		 568 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  34.82 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  38.04 
 
 		 306 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  33.47 
 
 		 559 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  36.97 
 
 		 315 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  38.1 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2931  anti-sigma-factor antagonist  29.96 
 
 		 338 aa  106  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353591  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  34.23 
 
 		 357 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  27.7 
 
 		 523 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  43.7 
 
 		 428 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  39.35 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4067  putative PAS/PAC sensor protein  45.76 
 
 		 429 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  39.33 
 
 		 653 aa  100  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  25.63 
 
 		 556 aa  100  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3473  anti-sigma-factor antagonist  27.7 
 
 		 422 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.551903  normal  0.0822697 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  39.57 
 
 		 562 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  44.07 
 
 		 655 aa  97.1  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  30.05 
 
 		 231 aa  97.1  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3508  anti-sigma-factor antagonist  36.71 
 
 		 359 aa  97.1  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  39.07 
 
 		 653 aa  96.7  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  36.6 
 
 		 323 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  42.07 
 
 		 357 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  38.18 
 
 		 388 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  44.44 
 
 		 653 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4153  anti-sigma-factor antagonist  33.46 
 
 		 425 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.893474  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4420  anti-sigma-factor antagonist  33.72 
 
 		 271 aa  95.1  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0621  anti-sigma-factor antagonist  38 
 
 		 377 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0312248 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  34.76 
 
 		 509 aa  94.7  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2387  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.51 
 
 		 604 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2210  anti-sigma-factor antagonist  28.98 
 
 		 580 aa  93.6  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 358 aa  93.2  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  35.26 
 
 		 549 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3609  anti-sigma-factor antagonist  29.68 
 
 		 411 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.196503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  40.13 
 
 		 388 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2296  anti-sigma-factor antagonist  34.33 
 
 		 342 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0948081  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  35.06 
 
 		 281 aa  91.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  37.68 
 
 		 362 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4421  anti-sigma-factor antagonist  42.24 
 
 		 271 aa  90.9  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0092  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 317 aa  91.3  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.463616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  33.99 
 
 		 538 aa  90.5  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 293 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  36.02 
 
 		 424 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1708  putative PAS/PAC sensor protein  32.95 
 
 		 444 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  38.97 
 
 		 290 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  39.1 
 
 		 433 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  40.6 
 
 		 445 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  33.12 
 
 		 694 aa  88.2  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3649  anti-sigma-factor antagonist  44.63 
 
 		 361 aa  87  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  39.1 
 
 		 439 aa  87  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1492  anti-sigma-factor antagonist  37.8 
 
 		 282 aa  87  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  39.5 
 
 		 291 aa  87  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  38.66 
 
 		 283 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 312 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1710  anti-sigma-factor antagonist  35.76 
 
 		 324 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.58 
 
 		 272 aa  85.5  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  35.17 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2986  anti-sigma-factor antagonist  33.79 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  29.96 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  41.59 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1936  anti-sigma-factor antagonist  41.04 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.729747  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2646  anti-sigma-factor antagonist  37.88 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1270  anti-sigma-factor antagonist  36 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1316  anti-sigma-factor antagonist  33.8 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  29.69 
 
 		 549 aa  84.3  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3016  anti-sigma-factor antagonist  31.07 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000586353  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1037  putative PAS/PAC sensor protein  35.71 
 
 		 484 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0799  anti-sigma-factor antagonist  35.77 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224753  hitchhiker  0.00639287 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  37.61 
 
 		 667 aa  83.6  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3857  anti-sigma-factor antagonist  39.57 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6425  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  24.6 
 
 		 588 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0129  anti-sigma-factor antagonist  36.67 
 
 		 287 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  41.44 
 
 		 638 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0221  anti-sigma-factor antagonist  37.58 
 
 		 366 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  37.04 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1239  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 314 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.974707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.31 
 
 		 890 aa  82.4  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0271774 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2416  anti-sigma-factor antagonist  31.28 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 680 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  35.86 
 
 		 689 aa  81.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  35.21 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1485  anti-sigma-factor antagonist  37.33 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  35.38 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3137  anti-sigma-factor antagonist  34.15 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225193  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  35.82 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  28.9 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0195  putative PAS/PAC sensor protein  35.61 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.1074  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3476  anti-sigma-factor antagonist  38.06 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.837777  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1671  anti-sigma-factor antagonist  36.52 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128227 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2689  anti-sigma-factor antagonist  37.12 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4858  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 		 295 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1219  positive regulator of sigma-B  33.61 
 
 		 286 aa  79.7  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1856  anti-sigma-factor antagonist  37.68 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.616563 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0148  putative PAS/PAC sensor protein  31.58 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6567  anti-sigma-factor antagonist  35.59 
 
 		 286 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967653  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2118  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  33.33 
 
 		 285 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.333632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0787  anti-sigma-factor antagonist  38.84 
 
 		 317 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>