More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4453 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
279 aa  574  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  91.04 
 
 
279 aa  531  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  59.14 
 
 
278 aa  342  5.999999999999999e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4112  alpha/beta hydrolase fold  50.36 
 
 
277 aa  295  6e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359232  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  45.25 
 
 
278 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  44.96 
 
 
284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  43.56 
 
 
273 aa  209  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  41.13 
 
 
310 aa  185  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  28.46 
 
 
277 aa  102  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  31.13 
 
 
259 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
290 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  26.07 
 
 
283 aa  97.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 
272 aa  96.7  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
405 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 
295 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
271 aa  95.9  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 
256 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 
350 aa  92.4  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.69 
 
 
372 aa  90.5  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  26.69 
 
 
259 aa  90.1  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  30.15 
 
 
282 aa  89.4  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
257 aa  89.4  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 
291 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.69 
 
 
370 aa  89.4  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
314 aa  89  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
361 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  25.56 
 
 
275 aa  87.4  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  27.07 
 
 
261 aa  87.4  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.52 
 
 
368 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  26.72 
 
 
256 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  26.72 
 
 
256 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.52 
 
 
368 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  25.5 
 
 
333 aa  86.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.1 
 
 
370 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  26.72 
 
 
256 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
270 aa  85.9  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.52 
 
 
368 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  25.31 
 
 
246 aa  85.1  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  22.86 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  25.09 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 
278 aa  82.8  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.64 
 
 
562 aa  83.2  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  25.6 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.41 
 
 
370 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  25.45 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
352 aa  82.4  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.31 
 
 
367 aa  82  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.07 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  25.82 
 
 
281 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.72 
 
 
370 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.28 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  25.6 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0013  Alpha/beta hydrolase fold  23.45 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal  0.992459 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  25.6 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  25.6 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  23.83 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  23.9 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  26.24 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  35.83 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.67 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.2 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  27.09 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  26.79 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  22.63 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  28.36 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  28.36 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  24.51 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1487  alpha/beta hydrolase fold protein  26.17 
 
 
267 aa  79  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  35.83 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  25.2 
 
 
261 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 
271 aa  79  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 
277 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  24.54 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  24.51 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  25.6 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  25.29 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.27 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  24.26 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  24.26 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  24.67 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  26.97 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  24.32 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  24.06 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  24.12 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>