86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4445 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4445  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  584  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.434289  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0795  hypothetical protein  76.95 
 
 
287 aa  443  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4443  hypothetical protein  96.3 
 
 
264 aa  427  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000339677  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4441  hypothetical protein  82.27 
 
 
285 aa  425  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000651212  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4440  hypothetical protein  95.81 
 
 
249 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0116829  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4444  hypothetical protein  93.52 
 
 
334 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0323466  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4442  hypothetical protein  94.84 
 
 
243 aa  414  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000374354  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0796  hypothetical protein  71.09 
 
 
261 aa  408  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0797  hypothetical protein  70.07 
 
 
254 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.530617  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3403  protein of unknown function DUF820  50.41 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320038 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1317  protein of unknown function DUF820  37.45 
 
 
295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1345  protein of unknown function DUF820  35.53 
 
 
281 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.05834  unclonable  0.00000000208542 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1743  hypothetical protein  35.11 
 
 
245 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311817  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
251 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1443  hypothetical protein  34.7 
 
 
224 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3834  hypothetical protein  32.53 
 
 
265 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3884  hypothetical protein  32.53 
 
 
265 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3529  protein of unknown function DUF820  28.63 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1187  protein of unknown function DUF820  31.28 
 
 
235 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000133784  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  39.24 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0800  protein of unknown function DUF820  31.22 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2812  hypothetical protein  32.18 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00715038  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3638  protein of unknown function DUF820  27.89 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  30.48 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  31.69 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2476  protein of unknown function DUF820  28.1 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4546  protein of unknown function DUF820  28.81 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2588  protein of unknown function DUF820  27.1 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.186035  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2988  hypothetical protein  28.28 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00225611  normal  0.747663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3073  hypothetical protein  33.05 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511109 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0157  protein of unknown function DUF820  27.35 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000154086  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1298  hypothetical protein  30.71 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1441  protein of unknown function DUF820  27.54 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1412  protein of unknown function DUF820  27.54 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0161  protein of unknown function DUF820  26.21 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  29.01 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  33.46 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3372  protein of unknown function DUF820  27.81 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  71.43 
 
 
244 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0590  protein of unknown function DUF820  30.89 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1780  protein of unknown function DUF820  28.69 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  29.66 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1484  protein of unknown function DUF820  25.89 
 
 
229 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000078309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2199  protein of unknown function DUF820  25.74 
 
 
265 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000553062 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  32.52 
 
 
243 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  28.88 
 
 
231 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0388  hypothetical protein  28.28 
 
 
227 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596384  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1875  hypothetical protein  27.61 
 
 
266 aa  58.9  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.631797  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0388  protein of unknown function DUF820  24.55 
 
 
256 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0379  protein of unknown function DUF820  24.11 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  35.59 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  30.28 
 
 
250 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  unclonable  0.00000000239983 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  30.28 
 
 
250 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  35.59 
 
 
249 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3900  protein of unknown function DUF820  31.36 
 
 
232 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0160105  normal  0.148171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  68.89 
 
 
230 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2447  protein of unknown function DUF820  25.25 
 
 
255 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1545  hypothetical protein  28.33 
 
 
254 aa  52.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0601  protein of unknown function DUF820  28.11 
 
 
222 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  26.36 
 
 
252 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000213894  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  26.36 
 
 
252 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1501  protein of unknown function DUF820  24.75 
 
 
245 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  30.43 
 
 
225 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3344  hypothetical protein  26.54 
 
 
256 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0816  hypothetical protein  55.38 
 
 
373 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00128516  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0024  protein of unknown function DUF820  57.14 
 
 
229 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  27.8 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1528  protein of unknown function DUF820  25.94 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  27.8 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  74.29 
 
 
222 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1054  protein of unknown function DUF820  30.3 
 
 
229 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.172098  hitchhiker  0.00807661 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3663  protein of unknown function DUF820  26.51 
 
 
255 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.730325  normal  0.78404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  53.97 
 
 
925 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  29.35 
 
 
254 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1228  protein of unknown function DUF820  24.48 
 
 
240 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0756  putative ribosomal protein L5-like protein  55.17 
 
 
359 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0450943  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0720  hypothetical protein  50 
 
 
359 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3591  protein of unknown function DUF820  23.33 
 
 
241 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0889916  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2515  protein of unknown function DUF820  23.33 
 
 
241 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2287  protein of unknown function DUF820  24.68 
 
 
239 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  hitchhiker  0.00756538 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  33.77 
 
 
2906 aa  44.3  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  36.62 
 
 
184 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4500  hypothetical protein  25.88 
 
 
260 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1632  hypothetical protein  48.72 
 
 
846 aa  43.1  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.790758 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0266  protein of unknown function DUF820  29.23 
 
 
226 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000132368  decreased coverage  0.00423088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  31.3 
 
 
651 aa  42.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>