80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4444 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4444  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  646    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0323466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4441  hypothetical protein  97.22 
 
 		 285 aa  441  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000651212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0795  hypothetical protein  68.48 
 
 		 287 aa  435  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4440  hypothetical protein  97.22 
 
 		 249 aa  434  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0116829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4442  hypothetical protein  97.18 
 
 		 243 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000374354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4443  hypothetical protein  94.91 
 
 		 264 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000339677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4445  hypothetical protein  93.52 
 
 		 298 aa  419  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.434289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0796  hypothetical protein  77.38 
 
 		 261 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0797  hypothetical protein  75.98 
 
 		 254 aa  396  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.530617  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3403  protein of unknown function DUF820  55.09 
 
 		 256 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320038 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1317  protein of unknown function DUF820  36.63 
 
 		 295 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1345  protein of unknown function DUF820  37.16 
 
 		 281 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.05834  unclonable  0.00000000208542 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1743  hypothetical protein  34.6 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1443  hypothetical protein  34.56 
 
 		 224 aa  99.4  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  34.16 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1187  protein of unknown function DUF820  32.6 
 
 		 235 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000133784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3834  hypothetical protein  35.83 
 
 		 265 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3884  hypothetical protein  35.42 
 
 		 265 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0800  protein of unknown function DUF820  32.02 
 
 		 238 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3529  protein of unknown function DUF820  29.92 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3638  protein of unknown function DUF820  28.82 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2812  hypothetical protein  31.82 
 
 		 252 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00715038  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  33.85 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0157  protein of unknown function DUF820  27.76 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000154086  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  30.73 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2476  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0161  protein of unknown function DUF820  28.11 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4546  protein of unknown function DUF820  30.96 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  30.42 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  61.9 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3073  hypothetical protein  33.91 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511109 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1298  hypothetical protein  32.71 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1412  protein of unknown function DUF820  27.35 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1441  protein of unknown function DUF820  27.35 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2588  protein of unknown function DUF820  30.3 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.186035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2988  hypothetical protein  28.21 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00225611  normal  0.747663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  30.65 
 
 		 259 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0590  protein of unknown function DUF820  29.41 
 
 		 241 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3372  protein of unknown function DUF820  27.81 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  55.45 
 
 		 925 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  30.22 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  65.08 
 
 		 244 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2199  protein of unknown function DUF820  26.14 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000553062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1484  protein of unknown function DUF820  26.24 
 
 		 229 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000078309 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  34.78 
 
 		 2906 aa  58.9  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0388  protein of unknown function DUF820  25.45 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  31.52 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0816  hypothetical protein  60.61 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00128516  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1875  hypothetical protein  28.94 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.631797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  35.14 
 
 		 2196 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0379  protein of unknown function DUF820  25 
 
 		 256 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0388  hypothetical protein  28.71 
 
 		 227 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0601  protein of unknown function DUF820  29.17 
 
 		 222 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  49.09 
 
 		 243 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  31.65 
 
 		 235 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  31.65 
 
 		 249 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1501  protein of unknown function DUF820  26.24 
 
 		 245 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  31.69 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  27.91 
 
 		 225 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  33.94 
 
 		 3242 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0720  hypothetical protein  62.96 
 
 		 359 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3900  protein of unknown function DUF820  34.1 
 
 		 232 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0160105  normal  0.148171 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  45 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  30.21 
 
 		 250 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  30.21 
 
 		 250 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  unclonable  0.00000000239983 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0756  putative ribosomal protein L5-like protein  60 
 
 		 359 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0450943  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  31.15 
 
 		 1026 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1528  protein of unknown function DUF820  27.14 
 
 		 238 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  29.45 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  53.97 
 
 		 230 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0603  hypothetical protein  60.87 
 
 		 373 aa  46.2  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0807218  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.71 
 
 		 561 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1545  hypothetical protein  25.12 
 
 		 254 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  33.54 
 
 		 651 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3088  TonB family protein  60.38 
 
 		 528 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0726849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3033  TonB family protein  60.38 
 
 		 528 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2196  hypothetical protein  71.88 
 
 		 217 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0469  TonB family protein  39.32 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  68.57 
 
 		 222 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2447  protein of unknown function DUF820  24.31 
 
 		 255 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>