92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4443 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4443  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  523  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000339677  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0796  hypothetical protein  82.38 
 
 
261 aa  434  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4441  hypothetical protein  86.32 
 
 
285 aa  432  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000651212  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0795  hypothetical protein  75.8 
 
 
287 aa  421  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4445  hypothetical protein  96.3 
 
 
298 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.434289  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4444  hypothetical protein  94.91 
 
 
334 aa  418  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0323466  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4442  hypothetical protein  96.71 
 
 
243 aa  419  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000374354  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0797  hypothetical protein  79.31 
 
 
254 aa  413  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.530617  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4440  hypothetical protein  94.91 
 
 
249 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0116829  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3403  protein of unknown function DUF820  51.54 
 
 
256 aa  241  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320038 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3834  hypothetical protein  37.69 
 
 
265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1743  hypothetical protein  34.26 
 
 
245 aa  112  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311817  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3884  hypothetical protein  36.84 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1443  hypothetical protein  34.02 
 
 
224 aa  105  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  33.45 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1317  protein of unknown function DUF820  36.67 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1187  protein of unknown function DUF820  32 
 
 
235 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000133784  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1345  protein of unknown function DUF820  36.67 
 
 
281 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.05834  unclonable  0.00000000208542 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0800  protein of unknown function DUF820  31.78 
 
 
238 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  32.66 
 
 
251 aa  95.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4546  protein of unknown function DUF820  33.08 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2812  hypothetical protein  37.25 
 
 
252 aa  86.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00715038  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3529  protein of unknown function DUF820  29.1 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  34.17 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2988  hypothetical protein  28.52 
 
 
240 aa  82.4  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00225611  normal  0.747663 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3638  protein of unknown function DUF820  29.26 
 
 
252 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  41.24 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0157  protein of unknown function DUF820  27.89 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000154086  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3073  hypothetical protein  32.02 
 
 
243 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  34.34 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1298  hypothetical protein  32.16 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2476  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0161  protein of unknown function DUF820  27.09 
 
 
257 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  38.21 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1412  protein of unknown function DUF820  28.45 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1441  protein of unknown function DUF820  28.45 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  34.01 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3900  protein of unknown function DUF820  37.3 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0160105  normal  0.148171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1780  protein of unknown function DUF820  30.4 
 
 
281 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1484  protein of unknown function DUF820  25.2 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000078309 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2588  protein of unknown function DUF820  27.61 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.186035  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0388  hypothetical protein  27.98 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596384  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0388  protein of unknown function DUF820  25.87 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0379  protein of unknown function DUF820  25.48 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  38.22 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0590  protein of unknown function DUF820  30.47 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3372  protein of unknown function DUF820  28.4 
 
 
260 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1875  hypothetical protein  32.75 
 
 
266 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.631797  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2447  protein of unknown function DUF820  28.2 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  29.9 
 
 
252 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000213894  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  29.9 
 
 
252 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2199  protein of unknown function DUF820  26.67 
 
 
265 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000553062 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0024  protein of unknown function DUF820  33.92 
 
 
229 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  34.1 
 
 
243 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  30.88 
 
 
243 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  30.88 
 
 
243 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1228  protein of unknown function DUF820  29.01 
 
 
240 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  28.79 
 
 
225 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2287  protein of unknown function DUF820  27.04 
 
 
239 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  hitchhiker  0.00756538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  33.18 
 
 
274 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  31.5 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  31.5 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  unclonable  0.00000000239983 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4990  protein of unknown function DUF820  31.37 
 
 
226 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3663  protein of unknown function DUF820  29.36 
 
 
255 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.730325  normal  0.78404 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1054  protein of unknown function DUF820  34.55 
 
 
229 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.172098  hitchhiker  0.00807661 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  32.24 
 
 
235 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2515  protein of unknown function DUF820  26.34 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3591  protein of unknown function DUF820  26.34 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0889916  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0266  protein of unknown function DUF820  28.43 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000132368  decreased coverage  0.00423088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2576  protein of unknown function DUF820  32.07 
 
 
227 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal  0.975603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1377  protein of unknown function DUF820  26.13 
 
 
249 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1193  hypothetical protein  37.5 
 
 
60 aa  53.1  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307979  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0601  protein of unknown function DUF820  29.7 
 
 
222 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  34.21 
 
 
222 aa  52.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1545  hypothetical protein  26.94 
 
 
254 aa  52  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3344  hypothetical protein  27.37 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1528  protein of unknown function DUF820  28.8 
 
 
238 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  26.75 
 
 
284 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1501  protein of unknown function DUF820  28.18 
 
 
245 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  36.56 
 
 
254 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1252  protein of unknown function DUF820  29.96 
 
 
247 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000809595  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  34.02 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0068  protein of unknown function DUF820  29.53 
 
 
230 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3851  protein of unknown function DUF820  31.89 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  29.33 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1876  hypothetical protein  45.76 
 
 
48 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2196  hypothetical protein  31.28 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203232  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  36.62 
 
 
184 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0580  protein of unknown function DUF820  27.55 
 
 
237 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1227  protein of unknown function DUF820  29.45 
 
 
217 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0721  protein of unknown function DUF820  28.08 
 
 
254 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00402744  normal  0.197954 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1198  protein of unknown function DUF820  28.83 
 
 
217 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>