83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4442 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4442  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  484  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000374354  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4441  hypothetical protein  82.81 
 
 
285 aa  435  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000651212  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4444  hypothetical protein  97.22 
 
 
334 aa  429  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0323466  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4440  hypothetical protein  95.58 
 
 
249 aa  427  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0116829  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4443  hypothetical protein  96.76 
 
 
264 aa  421  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000339677  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4445  hypothetical protein  94.91 
 
 
298 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.434289  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0796  hypothetical protein  75.86 
 
 
261 aa  394  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0797  hypothetical protein  77.17 
 
 
254 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.530617  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0795  hypothetical protein  69.4 
 
 
287 aa  385  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3403  protein of unknown function DUF820  48.62 
 
 
256 aa  221  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1443  hypothetical protein  38.12 
 
 
224 aa  118  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0800  protein of unknown function DUF820  33.9 
 
 
238 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1743  hypothetical protein  33.61 
 
 
245 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311817  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1187  protein of unknown function DUF820  32.2 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000133784  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2988  hypothetical protein  30.12 
 
 
240 aa  88.6  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00225611  normal  0.747663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2812  hypothetical protein  32.11 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00715038  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0388  protein of unknown function DUF820  28.51 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0379  protein of unknown function DUF820  28.09 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1484  protein of unknown function DUF820  28.94 
 
 
229 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000078309 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4546  protein of unknown function DUF820  31.45 
 
 
260 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3638  protein of unknown function DUF820  27.73 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3884  hypothetical protein  31.17 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3073  hypothetical protein  32.2 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3834  hypothetical protein  31.23 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1345  protein of unknown function DUF820  33.86 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.05834  unclonable  0.00000000208542 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0388  hypothetical protein  30.63 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596384  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2476  protein of unknown function DUF820  28.1 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1317  protein of unknown function DUF820  33.86 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4990  protein of unknown function DUF820  35.52 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3529  protein of unknown function DUF820  28.75 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1412  protein of unknown function DUF820  27.2 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1441  protein of unknown function DUF820  27.2 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0157  protein of unknown function DUF820  27.11 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000154086  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0266  protein of unknown function DUF820  32.24 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000132368  decreased coverage  0.00423088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0161  protein of unknown function DUF820  26.67 
 
 
257 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  28.11 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0590  protein of unknown function DUF820  30.6 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1875  hypothetical protein  32.93 
 
 
266 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.631797  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1780  protein of unknown function DUF820  26.87 
 
 
281 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1193  hypothetical protein  49.15 
 
 
60 aa  62.8  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307979  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2199  protein of unknown function DUF820  26.88 
 
 
265 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000553062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  29.8 
 
 
259 aa  62  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  30.11 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  28.7 
 
 
251 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  28.49 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3264  protein of unknown function DUF820  31.52 
 
 
210 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000019093  normal  0.268128 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2447  protein of unknown function DUF820  25.56 
 
 
255 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3372  protein of unknown function DUF820  27.04 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  30.37 
 
 
237 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1298  hypothetical protein  33.04 
 
 
262 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  32.24 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  32.24 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0601  protein of unknown function DUF820  29.95 
 
 
222 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3663  protein of unknown function DUF820  26.42 
 
 
255 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.730325  normal  0.78404 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2588  protein of unknown function DUF820  28.76 
 
 
279 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.186035  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1228  protein of unknown function DUF820  27.45 
 
 
240 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3591  protein of unknown function DUF820  25.25 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0889916  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  30.61 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  30.61 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2515  protein of unknown function DUF820  25.25 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  32.45 
 
 
274 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  30.06 
 
 
254 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3851  protein of unknown function DUF820  34.13 
 
 
218 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  34.27 
 
 
230 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2196  hypothetical protein  35.8 
 
 
217 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203232  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  29.03 
 
 
261 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  32.98 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  27.94 
 
 
252 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000213894  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  29.41 
 
 
252 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3222  protein of unknown function DUF820  28.49 
 
 
227 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3900  protein of unknown function DUF820  31.43 
 
 
232 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0160105  normal  0.148171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3344  hypothetical protein  24.19 
 
 
256 aa  45.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1252  protein of unknown function DUF820  27.43 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000809595  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2287  protein of unknown function DUF820  25.5 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  hitchhiker  0.00756538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  31.37 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1227  protein of unknown function DUF820  33.11 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  33.14 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2576  protein of unknown function DUF820  31.61 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal  0.975603 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1501  protein of unknown function DUF820  27.87 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1198  protein of unknown function DUF820  32.43 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5551  protein of unknown function DUF820  25.44 
 
 
212 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.540442 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  26.14 
 
 
284 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1528  protein of unknown function DUF820  27.32 
 
 
238 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>