More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4415 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4415  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
339 aa  676    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0760  glycosyl transferase family protein  77.71 
 
 
343 aa  474  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.057751 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  54.84 
 
 
319 aa  374  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  61.02 
 
 
329 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  59.55 
 
 
318 aa  368  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  59.49 
 
 
316 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  58.65 
 
 
314 aa  364  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  55.84 
 
 
314 aa  363  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  55.84 
 
 
314 aa  363  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2585  glycosyl transferase family protein  57.41 
 
 
316 aa  355  6.999999999999999e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  52.37 
 
 
324 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  56.7 
 
 
337 aa  346  3e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  54.97 
 
 
336 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  55.73 
 
 
329 aa  334  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  54.6 
 
 
320 aa  332  5e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  55.99 
 
 
320 aa  332  7.000000000000001e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  49.04 
 
 
320 aa  331  9e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  53.38 
 
 
342 aa  323  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  53.72 
 
 
320 aa  323  2e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  54.78 
 
 
336 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  54.46 
 
 
336 aa  322  6e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  53.02 
 
 
343 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  53.4 
 
 
320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  54.26 
 
 
337 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  46.5 
 
 
320 aa  320  3e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  51.9 
 
 
343 aa  315  5e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  46.5 
 
 
320 aa  315  7e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  47.88 
 
 
324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  53.82 
 
 
335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2286  glycosyl transferase family protein  46.42 
 
 
325 aa  311  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.398997  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  49.84 
 
 
321 aa  309  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  49.2 
 
 
344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.91 
 
 
320 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  51.91 
 
 
320 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  48.43 
 
 
319 aa  300  3e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  44.34 
 
 
332 aa  298  7e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0445  glycosyl transferase family 2  46.62 
 
 
334 aa  296  4e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1772  putative glycosyltransferase transmembrane protein  46.86 
 
 
347 aa  293  4e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.437602  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0656  glycosyl transferase family protein  46.69 
 
 
329 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  47.88 
 
 
313 aa  290  3e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  50 
 
 
314 aa  290  3e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  47.1 
 
 
368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  50.46 
 
 
358 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  46.23 
 
 
334 aa  283  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  44.13 
 
 
313 aa  280  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3622  glycosyl transferase family protein  48.07 
 
 
398 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00095064 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  43.83 
 
 
325 aa  280  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  44.72 
 
 
341 aa  276  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  46.96 
 
 
318 aa  276  4e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  46.96 
 
 
568 aa  276  4e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  43.91 
 
 
310 aa  276  5e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  44.86 
 
 
324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  46.2 
 
 
336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0955  glycosyl transferase family 2  43.58 
 
 
338 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254585  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  43.51 
 
 
312 aa  272  6e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  43.59 
 
 
312 aa  272  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2203  glycosyl transferase family 2  43.71 
 
 
315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  43.91 
 
 
310 aa  268  1e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  43.45 
 
 
310 aa  268  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  43.51 
 
 
310 aa  267  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  42.77 
 
 
331 aa  266  4e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  44.41 
 
 
323 aa  266  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  41.46 
 
 
314 aa  259  7e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1106  glycosyl transferase family 2  43.88 
 
 
338 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263485  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  43.08 
 
 
337 aa  255  9e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3181  glycosyl transferase family 2  40.13 
 
 
318 aa  250  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  43.17 
 
 
331 aa  248  9e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5120  glycosyl transferase family 2  39.53 
 
 
323 aa  248  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
315 aa  246  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11238  putative glycosyltransferase  39.2 
 
 
317 aa  246  3e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  39.41 
 
 
331 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1411  glycosyltransferase transmembrane protein  41.06 
 
 
302 aa  236  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  44.97 
 
 
328 aa  233  5e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2078  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  43.12 
 
 
327 aa  233  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  42.14 
 
 
322 aa  232  6e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  42.14 
 
 
322 aa  232  6e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  42.14 
 
 
322 aa  232  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  42.14 
 
 
322 aa  232  6e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  42.14 
 
 
322 aa  232  6e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  42.55 
 
 
327 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  42.55 
 
 
327 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  42.55 
 
 
327 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  42.55 
 
 
327 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  42.55 
 
 
327 aa  232  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
318 aa  231  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  41.82 
 
 
322 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  41.82 
 
 
322 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  42.14 
 
 
322 aa  230  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.85 
 
 
317 aa  230  3e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  39.6 
 
 
310 aa  226  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  41.21 
 
 
340 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  42.17 
 
 
326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3635  glycosyl transferase family 2  42.07 
 
 
312 aa  220  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.338719  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4016  glycosyl transferase family 2  40.45 
 
 
326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  40.32 
 
 
327 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4225  glycosyl transferase family 2  41.4 
 
 
327 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1792  b-glycosyltransferase  39.38 
 
 
324 aa  218  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.794906 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2611  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  40 
 
 
327 aa  216  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2690  glycosyl transferase family protein  40.89 
 
 
337 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2402  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.77 
 
 
335 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.745168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>