More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4381 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  100 
 
 
221 aa  442  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  72.69 
 
 
225 aa  308  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  40.69 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0009  hypothetical protein  36.82 
 
 
246 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  42.24 
 
 
265 aa  102  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  34.4 
 
 
273 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  44.86 
 
 
299 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  37.28 
 
 
262 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2127  methyltransferase type 11  37.02 
 
 
229 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  40 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  37.1 
 
 
224 aa  90.9  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  40 
 
 
216 aa  89.4  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  39.24 
 
 
216 aa  88.6  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  40.99 
 
 
219 aa  86.7  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  33.93 
 
 
207 aa  85.1  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1936  methyltransferase type 11  35.16 
 
 
213 aa  85.1  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227883  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  42.21 
 
 
219 aa  84  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0010  Methyltransferase type 11  43.75 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  36.07 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  36.53 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1487  methyltransferase type 11  34.32 
 
 
207 aa  82  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.69 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1009  Methyltransferase type 11  37.75 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00745554  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  40.28 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.41 
 
 
503 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1193  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0170367  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0544  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0016502  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3275  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00288656  normal  0.645972 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  31.98 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  34.06 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12035  hypothetical protein  39.52 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  38.95 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0761  Methyltransferase type 11  32 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.818805 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4073  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  41.88 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 
234 aa  72  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2712  putative phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  38.58 
 
 
226 aa  71.6  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870029  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  41.53 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  31.43 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04590  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.88 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.886413  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1124  methyltransferase type 11  30.29 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000131299  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  32.91 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  29.7 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.09 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  27.87 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.15 
 
 
259 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  30.71 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  29.05 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.34 
 
 
255 aa  67  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  34.31 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0840  methyltransferase type 11  25.42 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000045318  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  28 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.9 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  30.22 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.18 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  30.22 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0843  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  47.37 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  28.27 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  30.33 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0964  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  45.45 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417338  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0954  Methyltransferase type 11  29.02 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.118229  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  31.4 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  29.5 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  32.73 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  29.5 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  29.5 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  36.76 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  42 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  34.74 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  35.11 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  28.98 
 
 
257 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.81 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.14 
 
 
252 aa  64.3  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  32.4 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  36.47 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 
226 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.41 
 
 
345 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
232 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  39.02 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  44.04 
 
 
293 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  33.1 
 
 
280 aa  63.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  40 
 
 
272 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  38.36 
 
 
299 aa  63.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  36.73 
 
 
244 aa  63.2  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  32.3 
 
 
265 aa  63.2  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3929  UbiE/COQ5 methyltransferase  43.01 
 
 
269 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  40.54 
 
 
275 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.12 
 
 
232 aa  63.5  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  39.29 
 
 
196 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  40.54 
 
 
275 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2723  Methyltransferase type 11  41.35 
 
 
200 aa  62.8  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  36.54 
 
 
273 aa  62.8  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
284 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>