More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4362 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4362  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  518  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.144565 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0718  hypothetical protein  96.08 
 
 
255 aa  501  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2594  hypothetical protein  75.79 
 
 
252 aa  399  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000460429 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3030  hypothetical protein  61.42 
 
 
252 aa  323  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.248633  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  52.4 
 
 
252 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  51.03 
 
 
242 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  49.8 
 
 
250 aa  249  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  50.2 
 
 
247 aa  246  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  47.84 
 
 
253 aa  246  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  49.8 
 
 
247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  50.79 
 
 
249 aa  242  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  48.22 
 
 
247 aa  241  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  49.8 
 
 
251 aa  241  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  49.41 
 
 
247 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  49.38 
 
 
246 aa  239  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1634  protein of unknown function DUF28  50.2 
 
 
252 aa  238  5e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  50.2 
 
 
247 aa  237  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  50 
 
 
250 aa  237  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  51.36 
 
 
250 aa  237  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  49.59 
 
 
250 aa  236  3e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  49.59 
 
 
250 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  48.82 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  52.7 
 
 
243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  46.25 
 
 
247 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  50.2 
 
 
249 aa  231  7.000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  48.36 
 
 
243 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  46.56 
 
 
246 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  46.25 
 
 
247 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  51.61 
 
 
250 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1228  hypothetical protein  48.02 
 
 
252 aa  229  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150429  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  48.78 
 
 
250 aa  227  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0496  hypothetical protein  50.81 
 
 
250 aa  226  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.813063  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  47.74 
 
 
246 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0444  hypothetical protein  51.19 
 
 
251 aa  226  4e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1704  hypothetical protein  52.33 
 
 
252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609953  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  48.22 
 
 
253 aa  225  6e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  47.56 
 
 
250 aa  225  6e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  49.8 
 
 
248 aa  224  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  48.22 
 
 
253 aa  224  9e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  49.4 
 
 
248 aa  224  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  49.41 
 
 
248 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  49.18 
 
 
247 aa  222  4e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  44.44 
 
 
249 aa  222  4e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  48.22 
 
 
252 aa  222  4e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  47.39 
 
 
248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  48.43 
 
 
250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  48.62 
 
 
248 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  48 
 
 
246 aa  220  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  48 
 
 
246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_386  hypothetical protein  49.6 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  48.22 
 
 
248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1650  protein of unknown function DUF28  44.62 
 
 
247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  48 
 
 
246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  47.6 
 
 
246 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  47.83 
 
 
248 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  47.6 
 
 
246 aa  219  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0421  hypothetical protein  48.41 
 
 
251 aa  219  3e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  47.6 
 
 
246 aa  219  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  47.6 
 
 
246 aa  219  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  47.6 
 
 
246 aa  219  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  47.79 
 
 
249 aa  219  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  47.6 
 
 
246 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0025  hypothetical protein  47.62 
 
 
243 aa  219  3e-56  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0807  hypothetical protein  50.2 
 
 
251 aa  218  6e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2775  hypothetical protein  46.09 
 
 
255 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  44.44 
 
 
249 aa  218  8.999999999999998e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  46.46 
 
 
252 aa  217  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2066  hypothetical protein  47.24 
 
 
250 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  48.75 
 
 
248 aa  217  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2117  protein of unknown function DUF28  48.56 
 
 
247 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.892674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  44.8 
 
 
246 aa  217  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  49.8 
 
 
252 aa  218  1e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  47.2 
 
 
246 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  47.2 
 
 
246 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  47.2 
 
 
246 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  46.8 
 
 
246 aa  216  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  47.2 
 
 
246 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2108  protein of unknown function DUF28  47.6 
 
 
249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00811013  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0768  hypothetical protein  47.54 
 
 
240 aa  216  2.9999999999999998e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0981887  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3629  hypothetical protein  44.84 
 
 
252 aa  216  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000422691  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3398  protein of unknown function DUF28  45.31 
 
 
255 aa  216  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438869  decreased coverage  0.000000218577 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  45.6 
 
 
248 aa  216  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0925  protein of unknown function DUF28  45.45 
 
 
250 aa  215  5e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.488101  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  48.82 
 
 
249 aa  215  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  47.01 
 
 
247 aa  215  7e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  46.8 
 
 
247 aa  215  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  47.83 
 
 
248 aa  214  8e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  46.8 
 
 
246 aa  214  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  47.01 
 
 
247 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  45.45 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  47.58 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0323  protein of unknown function DUF28  43.08 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0125354  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  46.22 
 
 
247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  47.6 
 
 
249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1368  hypothetical protein  45.63 
 
 
251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  45.06 
 
 
248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  45.06 
 
 
248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  45.06 
 
 
248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  47.37 
 
 
248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5147  hypothetical protein  45.24 
 
 
251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000302619  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>