More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4357 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  83.24 
 
 		 187 aa  299  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  53.18 
 
 		 173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  47.2 
 
 		 158 aa  148  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  45.06 
 
 		 171 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  46.36 
 
 		 161 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  42.94 
 
 		 163 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  42.76 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  42.94 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  40.94 
 
 		 154 aa  131  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  40.94 
 
 		 154 aa  131  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  45.75 
 
 		 152 aa  130  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  42.33 
 
 		 163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  42.5 
 
 		 184 aa  129  4.0000000000000003e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  40.76 
 
 		 156 aa  128  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  41.33 
 
 		 161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  42.57 
 
 		 152 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  42.11 
 
 		 153 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  43.23 
 
 		 160 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  43.71 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  42.95 
 
 		 159 aa  121  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  41.51 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  47.52 
 
 		 159 aa  118  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  39.47 
 
 		 157 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  38.79 
 
 		 174 aa  117  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  40.97 
 
 		 152 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  39.47 
 
 		 157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  38.71 
 
 		 155 aa  116  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  41.72 
 
 		 153 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  39.47 
 
 		 157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  38.82 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  38.16 
 
 		 157 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  38.16 
 
 		 157 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  41.72 
 
 		 153 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  38.16 
 
 		 157 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  38.16 
 
 		 157 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  38.16 
 
 		 157 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  35.8 
 
 		 158 aa  114  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  39.33 
 
 		 152 aa  114  8.999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  38.82 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  38.16 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  39.35 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  39.24 
 
 		 160 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  36.36 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  43.09 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  48.03 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 		 176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  48.03 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  48.03 
 
 		 188 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  40.37 
 
 		 160 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  40.4 
 
 		 164 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  37.84 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  41.38 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 		 150 aa  106  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  40.28 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  39.06 
 
 		 143 aa  105  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  48.72 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  38.41 
 
 		 149 aa  105  6e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  36.71 
 
 		 156 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  36.03 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  37.67 
 
 		 155 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  35.29 
 
 		 152 aa  97.8  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  35.06 
 
 		 152 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  38.26 
 
 		 161 aa  97.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  35.06 
 
 		 152 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  35.06 
 
 		 152 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  35.06 
 
 		 152 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0927  hypothetical protein  37.01 
 
 		 138 aa  96.7  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.641059 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1524  hypothetical protein  36.71 
 
 		 159 aa  96.7  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.535681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  36.99 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  37.8 
 
 		 149 aa  96.7  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  34.48 
 
 		 157 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  34.56 
 
 		 152 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  34.56 
 
 		 151 aa  95.9  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  34.56 
 
 		 152 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  33.82 
 
 		 152 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  44 
 
 		 163 aa  94.7  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  44.35 
 
 		 506 aa  94.4  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  33.79 
 
 		 157 aa  94.4  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1081  ATPase  35.11 
 
 		 156 aa  94.4  8e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  43.41 
 
 		 165 aa  94.4  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  35.29 
 
 		 164 aa  94.4  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  36.43 
 
 		 143 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  35.29 
 
 		 164 aa  94.4  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  35.76 
 
 		 153 aa  94  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  40.38 
 
 		 164 aa  94  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  35.43 
 
 		 153 aa  94  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  35.92 
 
 		 142 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1604  protein of unknown function UPF0079  43.12 
 
 		 135 aa  93.2  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  35.25 
 
 		 160 aa  93.6  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  34.03 
 
 		 144 aa  93.2  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  34.48 
 
 		 157 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  37.93 
 
 		 513 aa  92.8  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  38.93 
 
 		 503 aa  92.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  37.93 
 
 		 513 aa  92.8  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  36.57 
 
 		 158 aa  92.8  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  34.48 
 
 		 157 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  32.12 
 
 		 154 aa  92.4  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  34.93 
 
 		 147 aa  92.8  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  37.19 
 
 		 157 aa  92  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>