More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4344 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 332 aa  665    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  88.25 
 
 		 332 aa  591  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  60.99 
 
 		 337 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  60.68 
 
 		 336 aa  394  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  60.75 
 
 		 326 aa  391  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  61.29 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  59.38 
 
 		 335 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  59.08 
 
 		 333 aa  386  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  58.59 
 
 		 335 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  57.67 
 
 		 335 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  57.67 
 
 		 335 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  56.6 
 
 		 324 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  56.29 
 
 		 324 aa  345  6e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  53.11 
 
 		 325 aa  338  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  51.58 
 
 		 324 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  52.22 
 
 		 353 aa  332  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  50 
 
 		 339 aa  329  5.0000000000000004e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  51.74 
 
 		 325 aa  325  7e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  50.32 
 
 		 324 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  50.63 
 
 		 326 aa  322  4e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  51.42 
 
 		 335 aa  322  8e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  49.84 
 
 		 346 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  49.38 
 
 		 342 aa  319  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  48.6 
 
 		 325 aa  309  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  47.98 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  48.73 
 
 		 323 aa  296  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  57.14 
 
 		 447 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  50.94 
 
 		 336 aa  294  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  44.72 
 
 		 327 aa  279  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  45.77 
 
 		 331 aa  275  9e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  47.83 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  44.97 
 
 		 326 aa  268  8e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  47.2 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  46.89 
 
 		 325 aa  266  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  43.03 
 
 		 327 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  44.03 
 
 		 326 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  43.71 
 
 		 326 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  43.4 
 
 		 331 aa  262  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  45.28 
 
 		 324 aa  259  6e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  41.8 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0197  2-dehydropantoate 2-reductase  43.71 
 
 		 324 aa  248  9e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  42.14 
 
 		 324 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  41.32 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  41.82 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  41.82 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  41.64 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  41.82 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  40.94 
 
 		 333 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  44.83 
 
 		 325 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2330  2-dehydropantoate 2-reductase  40.74 
 
 		 337 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.787912  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1345  2-dehydropantoate 2-reductase  40.38 
 
 		 332 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162184  normal  0.0787128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  42.15 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  40.38 
 
 		 332 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  40.38 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  39.12 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  38.8 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  38.8 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  38.8 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0153  2-dehydropantoate 2-reductase  42.12 
 
 		 351 aa  219  7e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  41.53 
 
 		 334 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  35.71 
 
 		 327 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  37.54 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  36.16 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  34.97 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3657  ketopantoate reductase ApbA/PanE  40.84 
 
 		 223 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7671 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03720  2-dehydropantoate 2-reductase  36.18 
 
 		 314 aa  132  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  33.74 
 
 		 335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2699  2-dehydropantoate 2-reductase  35.62 
 
 		 322 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  34.29 
 
 		 311 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  31.79 
 
 		 299 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  34.67 
 
 		 315 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  33.11 
 
 		 306 aa  125  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  31.17 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  31.5 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  29.61 
 
 		 312 aa  119  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  30.63 
 
 		 312 aa  116  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  29.81 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  31.06 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  27.13 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 		 302 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  29.55 
 
 		 312 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  30.15 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  26.22 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  30.24 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  29.57 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  29.57 
 
 		 315 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  30.16 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  29.84 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  30.09 
 
 		 315 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  29.48 
 
 		 307 aa  105  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  26.71 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  31.42 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  30.77 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  27.33 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  27.33 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  29.13 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  30.46 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>