More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4323 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  501  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  90.35 
 
 		 231 aa  418  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  71.88 
 
 		 229 aa  325  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  60.62 
 
 		 250 aa  293  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.49 
 
 		 226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 242 aa  226  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 242 aa  224  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.73 
 
 		 236 aa  224  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  45.49 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245701 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  45.09 
 
 		 257 aa  205  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.781509  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2359  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.42 
 
 		 247 aa  201  8e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0990205  decreased coverage  0.00133027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0710  two component LuxR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 222 aa  161  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.96 
 
 		 224 aa  161  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1132  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.53 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.893152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  38.25 
 
 		 213 aa  155  8e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.99 
 
 		 217 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.08 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1162  two component LuxR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 225 aa  151  7e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.130665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  36 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.38 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.9 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1350  LuxR family DNA-binding response regulator  35.16 
 
 		 225 aa  150  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00111586  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0759  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 238 aa  148  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.07 
 
 		 212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 220 aa  146  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.94 
 
 		 236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 232 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.51 
 
 		 231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.43 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.74 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  33.64 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.88 
 
 		 212 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.43 
 
 		 219 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00321115  hitchhiker  0.000132937 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 216 aa  143  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.81 
 
 		 224 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  33.64 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  33.64 
 
 		 215 aa  141  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 213 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 213 aa  141  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  33.64 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  33.64 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  33.64 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  33.64 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  33.64 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  33.18 
 
 		 215 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.28 
 
 		 213 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 213 aa  141  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  35.09 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  32.56 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.08 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1053  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.54 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.295708  normal  0.0294181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  36.99 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  35.34 
 
 		 242 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.5 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.32 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.32 
 
 		 217 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 213 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.62 
 
 		 223 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 237 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  31.19 
 
 		 229 aa  138  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  36.41 
 
 		 211 aa  138  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 223 aa  138  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  31.48 
 
 		 224 aa  138  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  31.48 
 
 		 224 aa  138  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 224 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.83 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0801  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.68 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.11 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.21 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  31.48 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  33.64 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  33.64 
 
 		 219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.74 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 213 aa  135  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.4 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  36.74 
 
 		 209 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  36.74 
 
 		 209 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  36.74 
 
 		 209 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  36.74 
 
 		 209 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.74 
 
 		 209 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>