More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4275 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  443  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  86.61 
 
 		 230 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4183  two component LuxR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 222 aa  181  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  44.93 
 
 		 239 aa  179  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.92 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1940  LuxR response regulator receiver  43.06 
 
 		 222 aa  175  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2130  DNA-binding response regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 222 aa  174  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.86 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5384  two component response regulator  44.81 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.81 
 
 		 217 aa  172  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 221 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  46.82 
 
 		 222 aa  171  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.42 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 234 aa  170  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.26 
 
 		 216 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.08 
 
 		 210 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.18 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 218 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 211 aa  169  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  47 
 
 		 219 aa  168  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.62 
 
 		 226 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.39 
 
 		 228 aa  168  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08490  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.34 
 
 		 236 aa  169  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199706  normal  0.526513 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.24 
 
 		 231 aa  168  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  46.7 
 
 		 227 aa  168  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 223 aa  167  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  42.72 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0209  two component LuxR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.24 
 
 		 222 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  41.78 
 
 		 215 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  42.72 
 
 		 215 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.95 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  42.72 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  42.72 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  42.72 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  42.72 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  42.72 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.74 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 237 aa  166  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.7 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.21 
 
 		 226 aa  165  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 212 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.98 
 
 		 221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 213 aa  164  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.66 
 
 		 239 aa  164  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 209 aa  164  9e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  42.2 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  41.78 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.45 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2391  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.06 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0696687  hitchhiker  0.00128542 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.99 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  43.58 
 
 		 219 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.29 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 218 aa  161  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.73 
 
 		 242 aa  161  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1435  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 218 aa  161  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 221 aa  161  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.72 
 
 		 225 aa  161  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.63 
 
 		 229 aa  161  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.15 
 
 		 217 aa  161  9e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.99 
 
 		 224 aa  161  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  41.52 
 
 		 221 aa  161  9e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  45.07 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.79 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  41.47 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  42.99 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4491  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.58 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.72 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.09 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4896  response regulator receiver  42.06 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.446448  normal  0.220667 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.13 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.4 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0602  nitrate/nitrite response regulator  42.58 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.790372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.62 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.74 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.84 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 216 aa  159  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  39.42 
 
 		 213 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  43.64 
 
 		 227 aa  158  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  39.42 
 
 		 213 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0645  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.72 
 
 		 220 aa  158  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.79 
 
 		 221 aa  158  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 250 aa  158  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  45.87 
 
 		 223 aa  158  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 209 aa  157  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>