More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4265 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 312 aa  642    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  83.28 
 
 		 311 aa  517  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  41.46 
 
 		 310 aa  229  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  44.71 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  41.19 
 
 		 705 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  44.06 
 
 		 313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  44.01 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  37.77 
 
 		 652 aa  209  4e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  45.28 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  40.62 
 
 		 298 aa  206  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  41.29 
 
 		 336 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  43.89 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  39.08 
 
 		 324 aa  202  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  39.66 
 
 		 306 aa  196  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  40.08 
 
 		 324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.93 
 
 		 355 aa  195  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  46.72 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  40.93 
 
 		 318 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  41.11 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  43.68 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  40.22 
 
 		 324 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  37.42 
 
 		 714 aa  189  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  39.54 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  39.38 
 
 		 318 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  39 
 
 		 318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  39 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  44.75 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  35.46 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  37.25 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  37.91 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  36.21 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  40.95 
 
 		 333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  33.45 
 
 		 289 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  37.13 
 
 		 334 aa  172  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 		 290 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  37.89 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  36.15 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.55 
 
 		 311 aa  165  9e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.47 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  35.79 
 
 		 304 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  36.24 
 
 		 340 aa  162  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  37.4 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 		 361 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 		 387 aa  156  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  35.84 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  35.27 
 
 		 314 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  38.34 
 
 		 318 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 		 325 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  34.25 
 
 		 317 aa  149  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  39.3 
 
 		 282 aa  149  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  35.06 
 
 		 360 aa  147  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  34.39 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  33.44 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  35.57 
 
 		 319 aa  143  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  33.77 
 
 		 327 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 		 334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  37.63 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  39.32 
 
 		 310 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  34.42 
 
 		 298 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  32.82 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  35.18 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  35.64 
 
 		 327 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  34.77 
 
 		 342 aa  133  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 		 312 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  35.17 
 
 		 318 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 		 296 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 		 296 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 		 296 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  29.23 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  35.77 
 
 		 331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 		 297 aa  129  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  34.1 
 
 		 312 aa  129  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  36.82 
 
 		 1340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  35.78 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.6 
 
 		 322 aa  126  6e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  26.45 
 
 		 297 aa  125  6e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  26.45 
 
 		 297 aa  125  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  34.58 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  29.27 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  33.85 
 
 		 274 aa  123  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  29.12 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 326 aa  122  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  34.63 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.85 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  33.85 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  34.26 
 
 		 324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 		 1152 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  26.83 
 
 		 338 aa  119  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 		 303 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 		 324 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 		 300 aa  119  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 		 679 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>