More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4259 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
269 aa  548  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  87.36 
 
 
269 aa  487  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  80.31 
 
 
269 aa  441  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.09 
 
 
262 aa  352  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  64.73 
 
 
262 aa  350  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  65.91 
 
 
269 aa  350  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.86 
 
 
260 aa  346  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  68.55 
 
 
269 aa  342  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  68.55 
 
 
269 aa  340  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  67.34 
 
 
269 aa  340  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.57 
 
 
273 aa  339  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  63.5 
 
 
280 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  66.54 
 
 
267 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  63.57 
 
 
269 aa  324  8.000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.11 
 
 
274 aa  322  4e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.56 
 
 
272 aa  317  1e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  63.56 
 
 
272 aa  317  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  61.72 
 
 
278 aa  315  4e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  61.33 
 
 
264 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  60.47 
 
 
264 aa  311  9e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  61.33 
 
 
290 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  61.33 
 
 
290 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  60.16 
 
 
264 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  60.94 
 
 
264 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  60.16 
 
 
264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.55 
 
 
269 aa  301  8.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  59.23 
 
 
261 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  59.23 
 
 
261 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  57.89 
 
 
266 aa  298  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  58.85 
 
 
261 aa  298  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  61.9 
 
 
272 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  61.9 
 
 
272 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  57.65 
 
 
265 aa  292  4e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  58.73 
 
 
270 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  53.49 
 
 
264 aa  276  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  52.71 
 
 
261 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  52.11 
 
 
262 aa  272  4.0000000000000004e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  54.65 
 
 
261 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  54.65 
 
 
261 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.47 
 
 
261 aa  271  6e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  59.92 
 
 
257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.44 
 
 
265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.21 
 
 
273 aa  265  5.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.37 
 
 
275 aa  262  4.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  52.36 
 
 
261 aa  259  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.92 
 
 
266 aa  256  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  50.38 
 
 
275 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  50.76 
 
 
275 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  50.57 
 
 
273 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.6 
 
 
263 aa  244  9e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  48.65 
 
 
264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  48.09 
 
 
275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  48.08 
 
 
275 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.62 
 
 
276 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  49.04 
 
 
266 aa  237  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  53.28 
 
 
261 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.41 
 
 
270 aa  230  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.59 
 
 
260 aa  228  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  46.18 
 
 
274 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.39 
 
 
266 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.78 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.39 
 
 
270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  46 
 
 
277 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  41.6 
 
 
270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.79 
 
 
255 aa  211  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.09 
 
 
269 aa  209  5e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 
265 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.97 
 
 
263 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  47.58 
 
 
273 aa  206  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  47.74 
 
 
257 aa  199  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.27 
 
 
258 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.49 
 
 
257 aa  190  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6359  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 
267 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0245012  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  41.7 
 
 
263 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  38.68 
 
 
258 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 
264 aa  149  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
257 aa  148  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.86 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.86 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.65 
 
 
259 aa  145  8.000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2144  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 
253 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268897  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.42 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  38.62 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
254 aa  138  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.46 
 
 
262 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3276  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  31.35 
 
 
265 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38470  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  31.35 
 
 
265 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.15 
 
 
259 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 
260 aa  135  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1889  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
261 aa  135  8e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>