More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4234 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 310 aa  642    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  41.46 
 
 		 312 aa  229  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  42.13 
 
 		 311 aa  223  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  39.22 
 
 		 313 aa  212  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  39.21 
 
 		 298 aa  212  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  37.99 
 
 		 705 aa  212  7e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  43.02 
 
 		 336 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  37.55 
 
 		 652 aa  211  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  36.05 
 
 		 308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  36.66 
 
 		 311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  37.13 
 
 		 306 aa  196  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  37.91 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  39 
 
 		 299 aa  192  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  41.11 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  39.39 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  38.55 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  36.75 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  39.38 
 
 		 318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  39 
 
 		 318 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  35.2 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  38.93 
 
 		 318 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  38.61 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.39 
 
 		 355 aa  176  3e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  32.53 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  36.64 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  40.08 
 
 		 333 aa  172  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 		 325 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 		 317 aa  165  8e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  33.1 
 
 		 334 aa  162  8.000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  36.33 
 
 		 361 aa  161  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  33.45 
 
 		 289 aa  159  8e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  35.94 
 
 		 714 aa  158  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  35.97 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 		 318 aa  156  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  34.53 
 
 		 334 aa  156  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 		 294 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  35.66 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  34.25 
 
 		 307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 		 324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  36.11 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 387 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  35.57 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 		 340 aa  145  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.25 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  33.59 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  35.57 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 		 360 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  29.37 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  29.72 
 
 		 297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  34.13 
 
 		 315 aa  136  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.13 
 
 		 315 aa  136  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.91 
 
 		 311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  30.62 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 		 327 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 		 327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  34.32 
 
 		 341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  30.12 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  31.85 
 
 		 1340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 		 305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  30.23 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 		 679 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  31.74 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 		 331 aa  123  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  32.96 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  31 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  28.24 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 		 624 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  26.9 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  31.72 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 		 1739 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0298  b-glycosyltransferase  27.38 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.917677  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 		 401 aa  112  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2264  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 		 270 aa  112  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 		 305 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 		 305 aa  112  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  29.73 
 
 		 2401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.05 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  28.74 
 
 		 274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 		 616 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  25.43 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 1267 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 		 1267 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>