More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4222 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  92.27 
 
 
414 aa  761    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
420 aa  843    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  76.5 
 
 
411 aa  600  1e-170  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  39.92 
 
 
304 aa  157  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
298 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  35.19 
 
 
410 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.45 
 
 
410 aa  140  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  35.47 
 
 
410 aa  140  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 
336 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  32.66 
 
 
394 aa  127  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  35.45 
 
 
221 aa  125  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
374 aa  123  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  34.68 
 
 
285 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  36.55 
 
 
229 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  27.42 
 
 
310 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  37.25 
 
 
291 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 
394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 
295 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
231 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  33.77 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3686  glycosyl transferase family 2  38.57 
 
 
234 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204283  hitchhiker  0.00350774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  34.22 
 
 
276 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  34.33 
 
 
273 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0164  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
262 aa  113  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.858664  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.3 
 
 
382 aa  112  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  34.76 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1866  glycosyl transferase family 2  32.77 
 
 
250 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1566  cell wall membrane glycosyltransferase  29.76 
 
 
314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.901523  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 
307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
287 aa  110  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2272  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 
236 aa  109  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.632375  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0438  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
298 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.599386 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  33.78 
 
 
257 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  31.56 
 
 
285 aa  107  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1057  glycosyl transferase family 2  34.86 
 
 
259 aa  106  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
320 aa  106  8e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4093  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
305 aa  106  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 
414 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7628  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 
306 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2074  glycosyl transferase family 2  29.04 
 
 
327 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 
262 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0731  family 2 glycosyl transferase  31.12 
 
 
298 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409725  normal  0.0143344 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 
321 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 
272 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
393 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
283 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 
314 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
238 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
299 aa  104  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 
242 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  30.64 
 
 
301 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
284 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 
320 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  28.85 
 
 
320 aa  103  8e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  30.62 
 
 
305 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2523  fused dolichol-phosphate mannosyltransferase/uncharacterized protein  30.31 
 
 
305 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.49497  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  29.06 
 
 
574 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0447  glycosyl transferase family 2  31.38 
 
 
284 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1368  glycosyl transferase, family 2  30.17 
 
 
309 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
253 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  32.53 
 
 
355 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
332 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
318 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
282 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3901  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
311 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3320  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.15 
 
 
301 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0730  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
364 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578304  normal  0.224353 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 
242 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 
320 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5400  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
242 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3900  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
254 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 
320 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  28.74 
 
 
313 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3985  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
472 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1727  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
329 aa  100  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.350304  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.92 
 
 
239 aa  100  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
430 aa  100  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 
320 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0478  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 
371 aa  100  6e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5883  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
314 aa  99.8  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
311 aa  99.8  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5607  glycosyl transferase family 2  35.05 
 
 
242 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  32.49 
 
 
227 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3351  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
434 aa  98.2  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0805099  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
241 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 
227 aa  97.1  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  29.97 
 
 
332 aa  96.7  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
346 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
232 aa  96.7  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0974  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.84 
 
 
233 aa  96.7  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.85219  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4177  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 
432 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  37.98 
 
 
237 aa  96.3  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 
249 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  35.02 
 
 
353 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3866  glycosyl transferase family 2  27.82 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0214545  decreased coverage  0.00118676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  27.99 
 
 
331 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 
389 aa  95.9  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  28.62 
 
 
309 aa  95.9  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1468  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.73 
 
 
371 aa  95.5  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>