184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4205 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  84.31 
 
 		 204 aa  357  5e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  62.93 
 
 		 205 aa  261  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0684  hypothetical protein  61.95 
 
 		 205 aa  251  7e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.08866  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  60 
 
 		 205 aa  248  5e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  62.43 
 
 		 205 aa  243  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1865  hypothetical protein  61.54 
 
 		 205 aa  242  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0217  hypothetical protein  60.78 
 
 		 233 aa  241  6e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  normal  0.202334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2595  hypothetical protein  59.61 
 
 		 205 aa  239  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  40.98 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3074  hypothetical protein  45.99 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  36.67 
 
 		 201 aa  101  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  35.91 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  34.25 
 
 		 197 aa  89.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  29.79 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  34.25 
 
 		 197 aa  89  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  34.44 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  34.81 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  27.12 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  27.43 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  29.51 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  28.96 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  27.72 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  28.18 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  28.43 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  29.66 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  29.26 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  26.88 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  26.21 
 
 		 257 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  27.03 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  29.14 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  30.19 
 
 		 180 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  29.71 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  27.43 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  35.14 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  29.09 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  32.37 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  30.3 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  35.14 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  27.42 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  31.58 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  28.57 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  28.19 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  30.77 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  30.11 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4750  protein of unknown function DUF820  31.28 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  hitchhiker  0.000000893331 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  29.21 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  32.67 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  31.06 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  22.99 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  31.74 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  25.41 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  26.16 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3352  hypothetical protein  35.58 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0400145  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  27.89 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  29.82 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  33.81 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  32.85 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  27.87 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  25.64 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0863  protein of unknown function DUF820  30.34 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000768463  decreased coverage  0.000000790424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  29.07 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  29.89 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  22.86 
 
 		 181 aa  62  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  26.55 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  26.74 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  31.34 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  27.17 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  25.54 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1385  protein of unknown function DUF820  25.97 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1419  protein of unknown function DUF820  25.41 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4229  hypothetical protein  28.99 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  26.37 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  29.66 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  25.53 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  32.12 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0380  hypothetical protein  30.95 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2157  protein of unknown function DUF820  34.97 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  29.03 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  29.45 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  25.41 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1833  hypothetical protein  32.06 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  33.03 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  25 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1503  hypothetical protein  36.59 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000135867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  23.88 
 
 		 244 aa  53.9  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  28.66 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1703  hypothetical protein  43.59 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2991  protein of unknown function DUF820  30.95 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0645262  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1702  hypothetical protein  43.59 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0749103 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3414  protein of unknown function DUF820  26.67 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0726  hypothetical protein  27.54 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.225388  normal  0.518771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1272  protein of unknown function DUF820  26.11 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0819  protein of unknown function DUF820  39.51 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0957178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1492  hypothetical protein  29.84 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4202  hypothetical protein  28.03 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.313101 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0094  hypothetical protein  29.75 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000049462  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2126  hypothetical protein  26.92 
 
 		 227 aa  51.6  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  27.67 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>