115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4204 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 346 aa  705    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  80 
 
 		 347 aa  568  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  43.56 
 
 		 344 aa  217  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  37.96 
 
 		 347 aa  209  5e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  37.85 
 
 		 347 aa  209  5e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  38.51 
 
 		 344 aa  206  4e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  36.61 
 
 		 362 aa  202  6e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0167  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 336 aa  123  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.205435  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  26.69 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  27.35 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 351 aa  94.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 		 323 aa  92.8  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  26.02 
 
 		 327 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 383 aa  90.1  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  26.02 
 
 		 327 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  25.85 
 
 		 328 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 338 aa  87  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  26.14 
 
 		 843 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  26.74 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  26.93 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  27.93 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  23.49 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  23.49 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  23.8 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  27.61 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  23.49 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 		 367 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  23.39 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  23.53 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  28.7 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  25.15 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  21.8 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  27.46 
 
 		 355 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  27.05 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  27.88 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  23.44 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  33.65 
 
 		 502 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  33.65 
 
 		 502 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  42.17 
 
 		 428 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  24.29 
 
 		 339 aa  53.5  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 		 342 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  38.89 
 
 		 482 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  24.93 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  42.17 
 
 		 425 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  34.44 
 
 		 467 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  37.04 
 
 		 466 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  37.04 
 
 		 466 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  38.81 
 
 		 469 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  25.07 
 
 		 319 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  36.96 
 
 		 519 aa  49.7  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  26.39 
 
 		 313 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_002620  TC0121  protoporphyrinogen oxidase  40 
 
 		 424 aa  47.8  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.138132  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  41.07 
 
 		 460 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  32.95 
 
 		 445 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  26.4 
 
 		 507 aa  47.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  39.73 
 
 		 499 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  39.73 
 
 		 499 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  30.82 
 
 		 415 aa  47  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  28.4 
 
 		 494 aa  47  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  40.98 
 
 		 492 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  36.67 
 
 		 512 aa  46.2  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  34.41 
 
 		 549 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  42.59 
 
 		 431 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  40.74 
 
 		 507 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  36.67 
 
 		 511 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  38.27 
 
 		 450 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  38.27 
 
 		 450 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  36.07 
 
 		 488 aa  44.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  43.64 
 
 		 418 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  35.48 
 
 		 546 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  24.44 
 
 		 456 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  37.31 
 
 		 531 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  36.67 
 
 		 511 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  41.54 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  35.71 
 
 		 490 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  36.67 
 
 		 511 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  36.67 
 
 		 511 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  41.82 
 
 		 448 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00981  hypothetical protein  21.94 
 
 		 371 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0926997  normal  0.536427 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  38.46 
 
 		 542 aa  43.9  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  37.04 
 
 		 505 aa  43.5  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  34.55 
 
 		 506 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>