More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4199 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 562 aa  1159    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  52.96 
 
 		 653 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  65.09 
 
 		 653 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  61.1 
 
 		 655 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  55.7 
 
 		 653 aa  418  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  39.11 
 
 		 428 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4067  putative PAS/PAC sensor protein  41.36 
 
 		 429 aa  206  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  39.69 
 
 		 430 aa  205  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  35.31 
 
 		 428 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  37.99 
 
 		 509 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  33.09 
 
 		 667 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  41.49 
 
 		 538 aa  179  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  37.7 
 
 		 424 aa  176  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  40.29 
 
 		 549 aa  176  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  58.9 
 
 		 323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  52.23 
 
 		 290 aa  159  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  44.78 
 
 		 295 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  50.69 
 
 		 638 aa  153  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  56.2 
 
 		 388 aa  153  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  32.18 
 
 		 433 aa  153  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  54.29 
 
 		 357 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  50.68 
 
 		 694 aa  151  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  49.33 
 
 		 312 aa  150  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3016  anti-sigma-factor antagonist  50.74 
 
 		 510 aa  141  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000586353  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  51.56 
 
 		 281 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4420  anti-sigma-factor antagonist  53.12 
 
 		 271 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  49.65 
 
 		 306 aa  138  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  34.97 
 
 		 315 aa  138  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4421  anti-sigma-factor antagonist  51.56 
 
 		 271 aa  137  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  45.51 
 
 		 293 aa  135  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  44.16 
 
 		 291 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4411  anti-sigma-factor antagonist  46.5 
 
 		 280 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  50.78 
 
 		 275 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  43.87 
 
 		 358 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  47.66 
 
 		 272 aa  130  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2416  anti-sigma-factor antagonist  47.86 
 
 		 288 aa  130  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5779  anti-sigma-factor antagonist  48.44 
 
 		 288 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1671  anti-sigma-factor antagonist  44.53 
 
 		 288 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128227 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  43.83 
 
 		 568 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1492  anti-sigma-factor antagonist  46.09 
 
 		 282 aa  125  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  43.17 
 
 		 271 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3133  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  46.09 
 
 		 283 aa  124  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3744  anti-sigma-factor antagonist  47.66 
 
 		 288 aa  124  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0129  anti-sigma-factor antagonist  45.39 
 
 		 287 aa  124  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2793  anti-sigma-factor antagonist  48.44 
 
 		 272 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0195  putative PAS/PAC sensor protein  40.12 
 
 		 255 aa  123  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.1074  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2486  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  50.43 
 
 		 294 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  47.69 
 
 		 315 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  46.21 
 
 		 376 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4970  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  43.38 
 
 		 284 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4858  anti-sigma-factor antagonist  45.74 
 
 		 295 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3768  anti-sigma-factor antagonist  42.31 
 
 		 284 aa  120  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0148  putative PAS/PAC sensor protein  33.2 
 
 		 299 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  43.33 
 
 		 283 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  46.21 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6567  anti-sigma-factor antagonist  45.8 
 
 		 286 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967653  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0799  anti-sigma-factor antagonist  44.53 
 
 		 286 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224753  hitchhiker  0.00639287 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0474  anti-sigma-factor antagonist  46.88 
 
 		 279 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.32 
 
 		 1094 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  45.08 
 
 		 286 aa  117  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2118  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  40.77 
 
 		 285 aa  117  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.333632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  44.93 
 
 		 377 aa  117  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  44.96 
 
 		 445 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2269  anti-sigma-factor antagonist  44.06 
 
 		 291 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5229  anti-sigma-factor antagonist  45.04 
 
 		 291 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  44.2 
 
 		 559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3339  anti-sigma-factor antagonist  45.04 
 
 		 292 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.123389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1219  positive regulator of sigma-B  39.39 
 
 		 286 aa  114  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0512  anti-sigma-factor antagonist  44.27 
 
 		 292 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2970  anti-sigma-factor antagonist  46.15 
 
 		 285 aa  113  9e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  50.45 
 
 		 385 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  44.85 
 
 		 372 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  44.85 
 
 		 361 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3137  anti-sigma-factor antagonist  40.62 
 
 		 283 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225193  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1270  anti-sigma-factor antagonist  44.03 
 
 		 325 aa  110  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  43.66 
 
 		 388 aa  110  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1316  anti-sigma-factor antagonist  35.52 
 
 		 284 aa  110  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3859  anti-sigma-factor antagonist  43.59 
 
 		 295 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  46.72 
 
 		 231 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  43.36 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 3706 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  41.73 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  43.36 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  42.54 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  43.7 
 
 		 689 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  44.44 
 
 		 370 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0868  anti-sigma-factor antagonist  42.28 
 
 		 506 aa  107  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121741 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  33.84 
 
 		 252 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  43.51 
 
 		 549 aa  105  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5196  anti-sigma-factor antagonist  39.1 
 
 		 365 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  44.88 
 
 		 556 aa  104  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4490  anti-sigma-factor antagonist  36.84 
 
 		 511 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  decreased coverage  0.000741245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2646  anti-sigma-factor antagonist  40.12 
 
 		 261 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1037  putative PAS/PAC sensor protein  40.83 
 
 		 484 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1856  anti-sigma-factor antagonist  39.33 
 
 		 365 aa  101  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.616563 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0577  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  35.61 
 
 		 308 aa  100  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1708  putative PAS/PAC sensor protein  33.99 
 
 		 444 aa  100  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 771 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  41.98 
 
 		 523 aa  99.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>