More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4186 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  55.97 
 
 
703 aa  743    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  58.27 
 
 
703 aa  784    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  87.48 
 
 
711 aa  1206    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  100 
 
 
711 aa  1415    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  39.35 
 
 
626 aa  416  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  39.7 
 
 
603 aa  412  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  37.35 
 
 
608 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  39.86 
 
 
577 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  39.93 
 
 
620 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  37.57 
 
 
603 aa  364  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  38.05 
 
 
584 aa  355  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  37.48 
 
 
599 aa  351  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  39.71 
 
 
730 aa  352  2e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  34.85 
 
 
580 aa  332  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  33.82 
 
 
573 aa  327  6e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  36.69 
 
 
588 aa  319  1e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2908  sulfate transporter  37.61 
 
 
590 aa  312  1e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00121599  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0024  sulphate transporter  39.8 
 
 
522 aa  310  6.999999999999999e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106653  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  35.75 
 
 
584 aa  306  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4099  sulphate transporter  36.8 
 
 
620 aa  305  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.54589 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0442  sulphate transporter  39.19 
 
 
584 aa  304  4.0000000000000003e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0091  sulphate transporter  41.19 
 
 
521 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266405  hitchhiker  0.00000000110429 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2081  sulphate transporter  36.06 
 
 
729 aa  296  8e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0094  sulphate transporter  40.48 
 
 
521 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317812  hitchhiker  0.000091476 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  32.97 
 
 
574 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0425  sulfate transporter  38.74 
 
 
601 aa  282  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0075  sulphate transporter  40.99 
 
 
521 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103886  hitchhiker  0.00048278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0062  sulphate transporter  39.31 
 
 
546 aa  279  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  32.49 
 
 
588 aa  278  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  34.09 
 
 
591 aa  276  8e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  33.85 
 
 
558 aa  271  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0026  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  37.47 
 
 
522 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  30.8 
 
 
585 aa  267  5e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0168  sulfate transporter family protein  38.45 
 
 
522 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  32.85 
 
 
578 aa  263  6e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0091  sulphate transporter  40.99 
 
 
521 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  32.53 
 
 
590 aa  262  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  33.09 
 
 
588 aa  259  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  32.61 
 
 
605 aa  258  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  33.16 
 
 
586 aa  251  4e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  28.8 
 
 
571 aa  250  8e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  32.9 
 
 
572 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  34.1 
 
 
517 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1634  sulphate transporter  35 
 
 
571 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141757  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  29.34 
 
 
586 aa  245  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  29.03 
 
 
587 aa  244  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  30.25 
 
 
585 aa  243  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  33.21 
 
 
592 aa  241  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  28.65 
 
 
574 aa  236  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00340  putative sulfate transporter  36.02 
 
 
517 aa  235  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0788781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  29.73 
 
 
581 aa  233  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  29.84 
 
 
583 aa  233  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1689  sulphate transporter  29.67 
 
 
605 aa  233  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1643  sulphate transporter  28.2 
 
 
583 aa  231  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4885  sulphate transporter  37.5 
 
 
698 aa  223  9e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3404  sulfate permease family protein  28.87 
 
 
587 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2846  sulphate transporter  30.8 
 
 
604 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.145004 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3287  sulphate transporter  29.31 
 
 
571 aa  218  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2275  sulphate transporter  29.77 
 
 
580 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.571929 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  27.65 
 
 
597 aa  216  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1599  sulphate transporter  29.57 
 
 
580 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3023  sulphate transporter  27.05 
 
 
574 aa  212  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.524361  normal  0.25764 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  28.21 
 
 
570 aa  206  9e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  29.7 
 
 
563 aa  206  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  29.66 
 
 
579 aa  206  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  29.15 
 
 
558 aa  205  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  28.2 
 
 
606 aa  204  6e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4982  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  31.57 
 
 
552 aa  203  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1459  SulP family sulfate permease  28.52 
 
 
551 aa  203  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.032999  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  29.47 
 
 
575 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  30.91 
 
 
572 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  28.52 
 
 
556 aa  201  3.9999999999999996e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  29.26 
 
 
596 aa  201  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  27.66 
 
 
570 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  27.37 
 
 
586 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  28.33 
 
 
560 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7075  sulphate transporter  30.2 
 
 
557 aa  198  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.469546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  28.86 
 
 
575 aa  198  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  25.28 
 
 
552 aa  198  3e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1731  SulP family sulfate permease  27.91 
 
 
551 aa  198  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.281721  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2470  sulphate transporter  32.96 
 
 
706 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.760506  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  28.09 
 
 
567 aa  197  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  28.41 
 
 
567 aa  196  9e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1078  sulfate transporter  26.11 
 
 
552 aa  196  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408762  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1792  SulP family sulfate permease  26.99 
 
 
570 aa  196  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3937  sulfate transporter  28.09 
 
 
573 aa  196  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483734  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  28.07 
 
 
582 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  27.64 
 
 
568 aa  194  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  27.19 
 
 
568 aa  192  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  26.67 
 
 
553 aa  192  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0840  sulfate transporter  28.08 
 
 
559 aa  192  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0897  sulfate transporter  33.53 
 
 
690 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.675666  normal  0.770489 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  30 
 
 
551 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1620  sulfate transporter  29.84 
 
 
582 aa  191  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  26.63 
 
 
579 aa  191  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  27.95 
 
 
584 aa  191  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2936  sulphate transporter  34.69 
 
 
508 aa  191  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304308  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  26.94 
 
 
570 aa  191  5.999999999999999e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  25.87 
 
 
552 aa  190  8e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  28.15 
 
 
580 aa  190  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>