More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4087 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
336 aa  685  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  54.27 
 
 
1032 aa  245  6e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  43.22 
 
 
278 aa  186  5e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  40.79 
 
 
261 aa  173  4e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  40.85 
 
 
253 aa  173  4e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  41.48 
 
 
1177 aa  168  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  41.48 
 
 
1177 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  41.74 
 
 
322 aa  166  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  40.66 
 
 
260 aa  164  2e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  34.94 
 
 
272 aa  160  4e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
334 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2182  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
293 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3648  glycosyl transferase family protein  35.95 
 
 
738 aa  140  2e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250737  normal  0.0159543 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0430  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  37.93 
 
 
642 aa  139  5e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5479  glycosyl transferase family 2  38.84 
 
 
655 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  37.44 
 
 
321 aa  121  2e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
777 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5459  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
660 aa  120  4e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  35.17 
 
 
338 aa  115  1e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0494  glycosyl transferase family 2  39.58 
 
 
674 aa  114  2e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11660  glycosyl transferase  34.93 
 
 
287 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 
812 aa  108  9e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  34.17 
 
 
773 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
318 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 
501 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
398 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 
310 aa  106  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  33.95 
 
 
373 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
350 aa  105  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  32.15 
 
 
300 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  32.48 
 
 
299 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  9.37683e-12 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  31.89 
 
 
727 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  32.04 
 
 
581 aa  104  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.74352e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  35.07 
 
 
294 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  31.92 
 
 
336 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.85438e-20 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
350 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
268 aa  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  34.9 
 
 
327 aa  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
316 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  34.45 
 
 
689 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  36.79 
 
 
544 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 
330 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  1.20628e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3881  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 
305 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  27.21 
 
 
323 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 
1476 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 
1035 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0888  b-glycosyltransferase  30.62 
 
 
333 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236559  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
347 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.04 
 
 
295 aa  99.8  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 
303 aa  99.8  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.37 
 
 
324 aa  99.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 
397 aa  99  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
305 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 
333 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1401  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
898 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.463731  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  31.42 
 
 
340 aa  99  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2458  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 
774 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.745195  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  36.22 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
299 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  34.98 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1497  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
898 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0238039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.7 
 
 
466 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  31.64 
 
 
704 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  39.25 
 
 
320 aa  97.1  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  35.03 
 
 
327 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  35.1 
 
 
321 aa  96.7  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 
325 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  32.19 
 
 
342 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  27.91 
 
 
970 aa  96.3  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 
276 aa  95.9  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.49 
 
 
294 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 
335 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
930 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.11 
 
 
312 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 
307 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1251  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
253 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
361 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  34.22 
 
 
324 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  33.84 
 
 
275 aa  94.7  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  32.97 
 
 
314 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  31.88 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.03 
 
 
341 aa  94.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 
374 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 
289 aa  94  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  33.87 
 
 
316 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 
301 aa  93.6  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
294 aa  93.6  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 
756 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 
329 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 
318 aa  93.2  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 
235 aa  92.8  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  31.8 
 
 
663 aa  92.4  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  41.32 
 
 
379 aa  92.4  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 
329 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  35.75 
 
 
308 aa  92  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 
335 aa  91.7  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
373 aa  92  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 
352 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2846  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 
305 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  35.26 
 
 
292 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>