More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4077 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 238 aa  484  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  57.51 
 
 		 238 aa  293  1e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0409  Nucleotidyl transferase  53.02 
 
 		 237 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.359368 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3723  Nucleotidyl transferase  48.73 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0885  Nucleotidyl transferase  46.29 
 
 		 229 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3557  nucleotidyl transferase  48.2 
 
 		 238 aa  208  7e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4321  Nucleotidyl transferase  41.53 
 
 		 238 aa  204  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  42.41 
 
 		 476 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0481  nucleotidyl transferase  42.06 
 
 		 267 aa  187  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.436885 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0598  nucleotidyl transferase  37.89 
 
 		 348 aa  185  4e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.534705  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4857  nucleotidyl transferase  39.91 
 
 		 351 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4088  nucleotidyl transferase  41.36 
 
 		 351 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  40.26 
 
 		 830 aa  182  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0560  nucleotidyl transferase  40.89 
 
 		 351 aa  179  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  40.26 
 
 		 833 aa  179  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  41.28 
 
 		 832 aa  178  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1231  flagellin modification protein PtmE, putative sugar-phosphate nucleotide transferase  36 
 
 		 345 aa  178  7e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000208573  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  38.7 
 
 		 820 aa  178  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1518  nucleotidyltransferase family protein  37.95 
 
 		 341 aa  177  1e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.973367  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  38.53 
 
 		 832 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0380  nucleotidyltransferase family protein  37.5 
 
 		 341 aa  175  6e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  40.77 
 
 		 832 aa  175  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  38.89 
 
 		 784 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2394  nucleotidyl transferase  38.67 
 
 		 346 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  40.25 
 
 		 834 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  38.89 
 
 		 784 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  40 
 
 		 828 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  37.29 
 
 		 843 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2301  nucleotidyl transferase  36.56 
 
 		 348 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0633  Nucleotidyl transferase  39.64 
 
 		 353 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  39.13 
 
 		 816 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  38.39 
 
 		 818 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  37.66 
 
 		 828 aa  170  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  36.6 
 
 		 841 aa  169  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  38.03 
 
 		 784 aa  168  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  38.03 
 
 		 784 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  38.03 
 
 		 784 aa  168  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  38.46 
 
 		 835 aa  168  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  38.43 
 
 		 820 aa  169  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  38.03 
 
 		 784 aa  168  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  38.03 
 
 		 784 aa  168  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3979  Nucleotidyl transferase  37.5 
 
 		 360 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1456  nucleotidyl transferase  37.02 
 
 		 361 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0757  nucleotidyl transferase  37.78 
 
 		 354 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  38.03 
 
 		 784 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2982  nucleotidyl transferase  38.12 
 
 		 350 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0566081  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3126  nucleotidyl transferase  38.12 
 
 		 350 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  40.62 
 
 		 810 aa  166  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  36.75 
 
 		 785 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  39.57 
 
 		 830 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  38.46 
 
 		 784 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01171  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  37.89 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  38.14 
 
 		 827 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  38.53 
 
 		 349 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  38.03 
 
 		 784 aa  164  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  37.34 
 
 		 828 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001798  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  40.62 
 
 		 352 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00676  mannose-1-phosphate guanyltransferase  38.5 
 
 		 352 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  37.66 
 
 		 842 aa  161  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  37.02 
 
 		 821 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  37 
 
 		 827 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2335  putative sugar-phosphate nucleotide transferase  38.33 
 
 		 352 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0321237  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0167  nucleotidyl transferase  41.52 
 
 		 352 aa  159  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0256  nucleotidyl transferase  41.52 
 
 		 352 aa  159  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  36.82 
 
 		 840 aa  158  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  33.89 
 
 		 348 aa  158  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0051  nucleotidyl transferase  38.05 
 
 		 351 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  34.96 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  35.95 
 
 		 833 aa  156  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  36.07 
 
 		 843 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2585  nucleotidyl transferase  37.27 
 
 		 367 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  36.82 
 
 		 842 aa  155  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3102  mannose-1-phosphate guanyltransferase  38.5 
 
 		 352 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0529  Nucleotidyl transferase  36.04 
 
 		 352 aa  155  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0365  Nucleotidyl transferase  39.45 
 
 		 355 aa  154  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  35.65 
 
 		 835 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14051  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  34.4 
 
 		 356 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  36.36 
 
 		 841 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  35.92 
 
 		 854 aa  152  4e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  36.36 
 
 		 392 aa  152  4e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  35.5 
 
 		 842 aa  152  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12391  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  37.61 
 
 		 353 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0812001  normal  0.0145083 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  35.93 
 
 		 361 aa  152  5e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  36.86 
 
 		 842 aa  151  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  33.2 
 
 		 828 aa  151  8e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  36.36 
 
 		 389 aa  151  8e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  36.52 
 
 		 818 aa  151  8.999999999999999e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  36.78 
 
 		 381 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  37.45 
 
 		 347 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.86 
 
 		 392 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  39.04 
 
 		 346 aa  150  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  35.22 
 
 		 712 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0952  Nucleotidyl transferase  35.6 
 
 		 388 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.95 
 
 		 392 aa  149  3e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0925  Nucleotidyl transferase  35.6 
 
 		 388 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  35.65 
 
 		 835 aa  149  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  34.82 
 
 		 776 aa  149  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  35.42 
 
 		 343 aa  149  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1580  nucleotidyl transferase  36.48 
 
 		 352 aa  148  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.995766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  35.06 
 
 		 361 aa  148  8e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>