More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4074 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  75.07 
 
 
756 aa  1107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
773 aa  1543  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4075  glycosyl transferase, group 1  36.43 
 
 
744 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3644  glycosyl transferase group 1  42.69 
 
 
478 aa  305  3e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102527  decreased coverage  7.73484e-05 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4094  glycosyl transferase, group 1  43.72 
 
 
468 aa  284  4e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.537371  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  25.38 
 
 
1177 aa  222  2e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 
1177 aa  220  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  39.57 
 
 
322 aa  142  2e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  41.67 
 
 
334 aa  142  2e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
321 aa  124  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  39.59 
 
 
278 aa  122  2e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  36.41 
 
 
1032 aa  121  4e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  36.76 
 
 
261 aa  117  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  33.51 
 
 
777 aa  114  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  35.33 
 
 
260 aa  113  2e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  33.76 
 
 
327 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  34.12 
 
 
253 aa  108  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  34.17 
 
 
336 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  31.19 
 
 
272 aa  108  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  35.46 
 
 
361 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3648  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 
738 aa  107  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250737  normal  0.0159543 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
261 aa  107  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0126  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
543 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 
350 aa  105  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 
316 aa  105  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11660  glycosyl transferase  37.22 
 
 
287 aa  103  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
299 aa  103  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 
318 aa  103  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 
324 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0430  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.33 
 
 
642 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 
347 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 
689 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1511  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.82 
 
 
382 aa  102  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  49.15 
 
 
330 aa  101  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  1.20628e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
398 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
337 aa  100  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  33.67 
 
 
316 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
318 aa  99  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 
349 aa  99  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  31.41 
 
 
305 aa  98.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 
386 aa  98.6  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1361  cell wall membrane glycosyltransferase  33.96 
 
 
290 aa  98.2  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 
386 aa  96.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 
373 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
323 aa  97.1  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.09 
 
 
377 aa  97.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  32.07 
 
 
458 aa  96.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  34.82 
 
 
300 aa  96.7  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  33.16 
 
 
303 aa  96.3  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  31.77 
 
 
333 aa  96.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0309  glycosyltransferase  39.11 
 
 
318 aa  95.9  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 
314 aa  95.9  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  35.95 
 
 
390 aa  95.5  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1181  glycosyltransferase, group 1 family protein  25.19 
 
 
579 aa  95.5  4e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  34.27 
 
 
353 aa  95.1  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.74 
 
 
312 aa  94.4  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.05 
 
 
295 aa  94.4  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  36.13 
 
 
289 aa  94  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
268 aa  93.6  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
344 aa  93.6  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 
373 aa  92.8  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  31.13 
 
 
395 aa  93.2  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.02 
 
 
365 aa  93.2  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  36.73 
 
 
388 aa  93.2  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.82 
 
 
407 aa  93.2  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  30.96 
 
 
311 aa  92.4  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  30.38 
 
 
401 aa  92  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  37.04 
 
 
300 aa  92.4  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 
672 aa  92.4  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 
337 aa  92.4  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
302 aa  92  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  24.59 
 
 
663 aa  91.3  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.68 
 
 
317 aa  91.7  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 
387 aa  91.3  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
414 aa  91.3  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  24.87 
 
 
377 aa  90.9  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  33.16 
 
 
1032 aa  90.5  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 
303 aa  90.5  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 
1015 aa  90.1  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  38.42 
 
 
411 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  31.42 
 
 
341 aa  90.1  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
376 aa  90.5  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  35.12 
 
 
322 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  28.83 
 
 
371 aa  90.5  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  35.07 
 
 
409 aa  90.1  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 
294 aa  89.7  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
330 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
384 aa  89  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1251  glycosyl transferase family 2  25.64 
 
 
253 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
310 aa  89  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  30.46 
 
 
1250 aa  89  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  30.96 
 
 
387 aa  89  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
352 aa  88.6  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
380 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5612  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
763 aa  89  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48049  normal  0.331243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  32.83 
 
 
2046 aa  88.6  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
597 aa  88.6  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 
294 aa  88.2  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  40.82 
 
 
333 aa  88.2  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  37.99 
 
 
400 aa  87.8  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>