More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4073 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
334 aa  671    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  81.99 
 
 
322 aa  511  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  44.21 
 
 
278 aa  165  9e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  40.78 
 
 
261 aa  160  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
336 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  38.7 
 
 
1177 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  38.7 
 
 
1177 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  41.75 
 
 
1032 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0430  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  41.82 
 
 
642 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  43.14 
 
 
260 aa  153  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 
253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 
777 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  40.99 
 
 
316 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  41.87 
 
 
773 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  33.98 
 
 
272 aa  142  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  37.13 
 
 
268 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2182  glycosyl transferase family 2  31.27 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  37.66 
 
 
312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  40.09 
 
 
756 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  38.14 
 
 
1476 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  34.66 
 
 
330 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  41.23 
 
 
544 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 
330 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3648  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 
738 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250737  normal  0.0159543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 
350 aa  123  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1251  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 
253 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  36.32 
 
 
318 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  37.26 
 
 
321 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 
299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  35.48 
 
 
380 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  36.1 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 
351 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  32.78 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
352 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  36.41 
 
 
689 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  35 
 
 
338 aa  116  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  37.79 
 
 
320 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  34.52 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  36.15 
 
 
361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
1035 aa  113  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2150  glycosyl transferase family 2  33.73 
 
 
302 aa  113  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  36.15 
 
 
347 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.03 
 
 
321 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 
347 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  34.25 
 
 
303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  37.24 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 
374 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 
501 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
314 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  32.92 
 
 
373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  33.78 
 
 
329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  37.23 
 
 
466 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  34.22 
 
 
953 aa  109  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 
349 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
573 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.52 
 
 
330 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
316 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  35.98 
 
 
294 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
261 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6398  glycosyl transferase family 2  33.97 
 
 
262 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.855353 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  33.48 
 
 
299 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  38.38 
 
 
300 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 
333 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
296 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
294 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  32.9 
 
 
300 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  34.16 
 
 
704 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 
339 aa  106  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 
398 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
310 aa  105  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 
327 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  34.27 
 
 
342 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  33.18 
 
 
255 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2846  glycosyl transferase family protein  36.95 
 
 
305 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
294 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 
313 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  27.4 
 
 
332 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
306 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  42.97 
 
 
983 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
390 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
331 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
302 aa  103  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
324 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  35.2 
 
 
336 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
329 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
363 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2831  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
345 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.242472  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0478  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
300 aa  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
274 aa  103  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.17 
 
 
294 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 
301 aa  102  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  36.24 
 
 
390 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  31.08 
 
 
294 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  43.31 
 
 
379 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
329 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 
324 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  35.91 
 
 
308 aa  102  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  29.8 
 
 
310 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  30.32 
 
 
341 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>