54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4040 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  948    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  90.65 
 
 		 450 aa  831    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  59.73 
 
 		 436 aa  500  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  57.85 
 
 		 425 aa  495  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  56.38 
 
 		 446 aa  492  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  55.86 
 
 		 476 aa  434  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  59.27 
 
 		 434 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  48.48 
 
 		 447 aa  414  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  47.41 
 
 		 453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  45.37 
 
 		 408 aa  365  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  46.15 
 
 		 600 aa  310  5e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  46.94 
 
 		 596 aa  303  5.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  46.94 
 
 		 597 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  44.7 
 
 		 601 aa  301  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  44.04 
 
 		 601 aa  296  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  40.22 
 
 		 586 aa  271  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  26.39 
 
 		 550 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  24.8 
 
 		 544 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2723  hypothetical protein  25.93 
 
 		 550 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  24.53 
 
 		 1025 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  27.03 
 
 		 372 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  26.74 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  24.57 
 
 		 340 aa  82.8  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  24.64 
 
 		 1276 aa  77  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  25.87 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  23.02 
 
 		 554 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  23.83 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  24.71 
 
 		 873 aa  65.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  24.18 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  24.35 
 
 		 891 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  23.12 
 
 		 596 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  23.4 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  23.01 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  22 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  23.46 
 
 		 662 aa  60.1  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  22.7 
 
 		 605 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  23.27 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  24.61 
 
 		 584 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  20.65 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  25.82 
 
 		 801 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  22.58 
 
 		 437 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3420  hypothetical protein  25.97 
 
 		 468 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5546  hypothetical protein  23.31 
 
 		 448 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  24.8 
 
 		 534 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  29.03 
 
 		 803 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2610  hypothetical protein  25.99 
 
 		 558 aa  47.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  25.42 
 
 		 602 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  23.1 
 
 		 1141 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1696  Beta-xylosidase  24.46 
 
 		 510 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  19.94 
 
 		 614 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1875  putative lipoprotein  24.16 
 
 		 510 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  25.97 
 
 		 450 aa  43.5  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1721  putative lipoprotein  24.46 
 
 		 510 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1111  hypothetical protein  26.99 
 
 		 452 aa  43.5  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>