32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3973 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3973  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 309 aa  612  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629775  normal  0.213011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1417  HEAT repeat-containing PBS lyase  84.79 
 
 		 309 aa  515  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.970236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3051  HEAT domain containing protein  52.33 
 
 		 304 aa  265  8e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.593239  hitchhiker  0.000276879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0081  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.38 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0952  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.43 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0524  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.05 
 
 		 316 aa  170  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.25489  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_465  PBS lyase heat-like repeat domain protein  37.84 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.089505  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0500  heat domain-containing protein  35.31 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.332473  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.32 
 
 		 1343 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1094 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  28.75 
 
 		 1328 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.94 
 
 		 1139 aa  56.2  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  24.09 
 
 		 958 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  29.5 
 
 		 1148 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  24.51 
 
 		 493 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.34 
 
 		 524 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2563  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  24.35 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.22 
 
 		 370 aa  46.6  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  24.14 
 
 		 395 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  24.14 
 
 		 395 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.51 
 
 		 510 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  27.01 
 
 		 959 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.83 
 
 		 666 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.14 
 
 		 180 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.03 
 
 		 823 aa  44.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  26.7 
 
 		 546 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.04 
 
 		 157 aa  43.9  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.84 
 
 		 1041 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.15 
 
 		 408 aa  43.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  24.04 
 
 		 501 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  28.15 
 
 		 1133 aa  42.7  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.21 
 
 		 641 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>