119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3941 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3941  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  100 
 
 
205 aa  415  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  80.98 
 
 
205 aa  345  3e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  36.92 
 
 
215 aa  106  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  35.1 
 
 
209 aa  99.8  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3530  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.96 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.488676 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0062  NADPH-dependent F420 reductase  32.13 
 
 
244 aa  81.6  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3738  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.33 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.152483  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  32.84 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.38 
 
 
316 aa  78.6  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1098  putative reductase  32.4 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0151402 
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  34.97 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2111  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.07 
 
 
240 aa  77  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  31.13 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7106  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.33 
 
 
223 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693363  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5762  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.35 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.904394 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5423  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  30.94 
 
 
257 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.21701  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3928  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  35.78 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3114  NADPH-dependent F420 reductase  32.18 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00100508  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1230  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.97 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1199  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.1 
 
 
212 aa  72  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.52333  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0125  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.93 
 
 
216 aa  71.2  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1370  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.87 
 
 
239 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77619  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0414  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.89 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167555  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  28.72 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.99 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.24 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2069  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.41 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4317  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.49 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644244  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3176  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.89 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4409  NADPH-dependent F420 reductase  28.95 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.614636  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2952  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  34.47 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5227  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent protein  32.67 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4167  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.14 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  32.02 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2534  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.54 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0026  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  26.27 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190951  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3858  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.54 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0710009 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0798  NADPH-dependent F420 reductase  25 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0821593  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0788  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.65 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6559  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35 
 
 
202 aa  63.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0892  NADPH-dependent F420 reductase  29.47 
 
 
222 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.33 
 
 
210 aa  62.4  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1428  NADPH-dependent F420 reductase  27.32 
 
 
220 aa  62  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2052  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.21 
 
 
191 aa  62  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0447  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.11 
 
 
251 aa  62  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481613  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1414  NADPH-dependent F420 reductase  28.08 
 
 
225 aa  61.6  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0741  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.91 
 
 
228 aa  61.6  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2198  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.94 
 
 
257 aa  61.2  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3151  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  32.29 
 
 
243 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1722  dinucleotide-binding protein  25 
 
 
190 aa  61.2  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0135732  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0864  NADPH-dependent F420 reductase  25.89 
 
 
223 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.6 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2584  NADPH-dependent f420 reductase  32.82 
 
 
221 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.16433 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5114  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.56 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.581328  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8069  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.38 
 
 
216 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1400  NADPH-dependent F420 reductase  28 
 
 
226 aa  60.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2407  hypothetical protein  30.57 
 
 
214 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2654  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.79 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1950  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.87 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1258  NADPH-dependent F420 reductase  24.65 
 
 
222 aa  58.9  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.826887  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3207  NADPH-dependent F420 reductase  28.5 
 
 
231 aa  58.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63362  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0864  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.73 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0940  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.14 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1646  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.37 
 
 
229 aa  57  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3343  NADPH-dependent F420 reductase  31.43 
 
 
232 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904937  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0816  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.84 
 
 
229 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428849  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2768  NADPH-dependent F420 reductase  26 
 
 
226 aa  56.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0944  dinucleotide-binding protein  24.59 
 
 
188 aa  55.8  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5227  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.22 
 
 
198 aa  55.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308385  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1120  NADPH-dependent F420 reductase  25.12 
 
 
223 aa  55.5  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0613  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.98 
 
 
226 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.356335  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2131  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.92 
 
 
219 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2310  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.28 
 
 
230 aa  54.7  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31010  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  30.81 
 
 
200 aa  55.1  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4570  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.05 
 
 
199 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5883  putative oxidoreductase  30.19 
 
 
249 aa  54.7  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228058  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1508  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.27 
 
 
198 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36320  predicted dinucleotide-binding enzyme  29.89 
 
 
218 aa  52.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3532  dinucleotide-binding protein-like protein  45.33 
 
 
132 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3140  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.78 
 
 
244 aa  52.4  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0244  dinucleotide-binding protein  28.26 
 
 
207 aa  52.4  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3964  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.6 
 
 
220 aa  51.6  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1760  NADPH-dependent F420 reductase  28.04 
 
 
227 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.00319562 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4044  NADPH-dependent F420 reductase  26.92 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11910  predicted dinucleotide-binding enzyme  29.41 
 
 
228 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1765  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.37 
 
 
209 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6638  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.81 
 
 
221 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3589  NADPH-dependent F420 reductase  29.67 
 
 
232 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000495197 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1051  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.61 
 
 
231 aa  49.3  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2205  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.25 
 
 
206 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302073  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0243  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  28.99 
 
 
225 aa  48.9  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2497  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.31 
 
 
253 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2885  hypothetical protein  33.33 
 
 
296 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3483  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.46 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5816  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  24.86 
 
 
244 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.092389 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1814  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.52 
 
 
275 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.657854 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  28.38 
 
 
287 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2931  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.82 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1119  NADPH-dependent F420 reductase  25.37 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0022  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  26.17 
 
 
225 aa  47  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>