More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3917 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  445  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  61.47 
 
 		 206 aa  255  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  68.57 
 
 		 70 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  61.97 
 
 		 136 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  58.97 
 
 		 81 aa  105  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  58.97 
 
 		 81 aa  105  6e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1630  hypothetical protein  61.97 
 
 		 81 aa  103  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.265757  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  62.32 
 
 		 82 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  63.64 
 
 		 69 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0765  hypothetical protein  71.21 
 
 		 68 aa  99.4  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0089362  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  60.87 
 
 		 85 aa  99  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  60.87 
 
 		 85 aa  99  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  59.15 
 
 		 99 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  59.15 
 
 		 85 aa  97.8  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  60.56 
 
 		 86 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0605  hypothetical protein  55.41 
 
 		 89 aa  97.1  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00151765  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3919  DNA polymerase beta subunit  49.07 
 
 		 117 aa  94.7  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1592  hypothetical protein  58.97 
 
 		 83 aa  94.4  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  45.98 
 
 		 98 aa  94  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  55.71 
 
 		 70 aa  93.2  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  54.93 
 
 		 78 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  54.93 
 
 		 78 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  54.93 
 
 		 78 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  54.93 
 
 		 78 aa  93.2  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4386  hypothetical protein  46.53 
 
 		 112 aa  92.8  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104224 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  54.29 
 
 		 86 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  44.86 
 
 		 104 aa  92  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  53.52 
 
 		 78 aa  92  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  53.52 
 
 		 78 aa  92  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  53.52 
 
 		 78 aa  92  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  53.52 
 
 		 78 aa  92  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  53.52 
 
 		 78 aa  92  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  53.52 
 
 		 75 aa  91.7  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  57.97 
 
 		 69 aa  92  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  54.93 
 
 		 86 aa  91.7  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 		 69 aa  91.7  8e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  49.38 
 
 		 105 aa  91.3  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  59.09 
 
 		 78 aa  90.9  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  52.86 
 
 		 70 aa  90.9  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  49.32 
 
 		 107 aa  90.9  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  44.83 
 
 		 98 aa  90.9  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  55.56 
 
 		 74 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  52.11 
 
 		 78 aa  90.5  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  52.11 
 
 		 72 aa  90.9  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  53.62 
 
 		 69 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  57.35 
 
 		 69 aa  90.5  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  57.14 
 
 		 97 aa  90.5  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  53.52 
 
 		 76 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  50.7 
 
 		 77 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  60.61 
 
 		 92 aa  89.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  53.52 
 
 		 76 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 71 aa  89.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  54.93 
 
 		 85 aa  89.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5948  protein of unknown function DUF37  46.43 
 
 		 87 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 		 69 aa  89.4  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  55.71 
 
 		 80 aa  89  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  52.78 
 
 		 84 aa  89  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  53.52 
 
 		 76 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  53.62 
 
 		 92 aa  88.6  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  54.17 
 
 		 85 aa  88.6  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  51.39 
 
 		 94 aa  88.2  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  46.67 
 
 		 83 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 		 75 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39780  conserved hypothetical protein TIGR00278  51.95 
 
 		 100 aa  87.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000230088  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  53.73 
 
 		 97 aa  87.4  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  49.28 
 
 		 79 aa  87.4  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3616  hypothetical protein  54.29 
 
 		 70 aa  86.7  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  54.41 
 
 		 89 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2267  hypothetical protein  57.81 
 
 		 79 aa  87.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 		 79 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 		 79 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  53.03 
 
 		 117 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  58.06 
 
 		 64 aa  87  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  43.37 
 
 		 96 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1110  protein of unknown function DUF37  57.97 
 
 		 69 aa  86.3  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5013  hypothetical protein  39.8 
 
 		 100 aa  86.3  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  51.35 
 
 		 91 aa  85.9  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  52.94 
 
 		 71 aa  85.9  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  45.78 
 
 		 105 aa  86.3  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  50.72 
 
 		 86 aa  86.3  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  52.86 
 
 		 87 aa  85.9  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  52.86 
 
 		 107 aa  85.9  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9054  protein of unknown function DUF37  49.3 
 
 		 134 aa  84.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00509296  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0218  hypothetical protein  49.28 
 
 		 88 aa  84.7  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  59.09 
 
 		 76 aa  84.3  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  43.37 
 
 		 91 aa  84  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  54.41 
 
 		 77 aa  84.3  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  52.86 
 
 		 82 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_912  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  84.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000074763  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3643  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 		 70 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00362393  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  50.7 
 
 		 84 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  50.7 
 
 		 115 aa  84  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0577  hypothetical protein  56.06 
 
 		 69 aa  83.6  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  53.73 
 
 		 91 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  51.43 
 
 		 88 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  59.02 
 
 		 110 aa  84  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4222  hypothetical protein  56.14 
 
 		 69 aa  83.2  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  56.45 
 
 		 73 aa  83.2  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  49.3 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3226  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.082492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>