57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3909 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3208  hypothetical protein  83.72 
 
 		 689 aa  1134    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.905159  normal  0.252675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3909  hypothetical protein  100 
 
 		 697 aa  1403    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  36.63 
 
 		 496 aa  207  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.81 
 
 		 943 aa  178  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5268  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 1958 aa  154  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.494598  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5145  hypothetical protein  29.11 
 
 		 1689 aa  120  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0775613  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2132  hypothetical protein  28.19 
 
 		 699 aa  111  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.565923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1238 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4219  heterocyst differentiation protein  24.78 
 
 		 806 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.638928 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0033  heterocyst differentiation protein HetF  24.93 
 
 		 823 aa  101  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3525  heterocyst differentiation protein  26.14 
 
 		 835 aa  101  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.857828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4363  hypothetical protein  27.76 
 
 		 534 aa  99.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.394148 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2711  FHA domain-containing protein  29.11 
 
 		 544 aa  94.7  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2236  hypothetical protein  24.52 
 
 		 467 aa  87.4  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555143  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0305  FHA domain-containing protein  28.74 
 
 		 525 aa  86.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3255  FHA domain containing protein  27.73 
 
 		 569 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 1313 aa  77.4  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3408  heat repeat-containing PBS lyase  28.06 
 
 		 1203 aa  73.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.539879 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  32.85 
 
 		 1914 aa  70.1  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 1063 aa  68.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1337  FHA domain-containing protein  23.8 
 
 		 559 aa  68.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1155  hypothetical protein  28.77 
 
 		 689 aa  67  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 		 1714 aa  67  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 1298 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 1285 aa  63.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2281  hypothetical protein  29.17 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503347  normal  0.134184 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3407  FHA domain containing protein  28.95 
 
 		 562 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2709  FHA domain containing protein  28.95 
 
 		 562 aa  60.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2011  hypothetical protein  26.53 
 
 		 684 aa  60.8  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1258  polysaccharide deacetylase  30.67 
 
 		 699 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2419  hypothetical protein  25.08 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.783894  normal  0.656965 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  28.14 
 
 		 1611 aa  59.3  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0503  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 		 705 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 1450 aa  57.4  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0589  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1921 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0461  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.97 
 
 		 1195 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1725  FHA domain containing protein  29.41 
 
 		 781 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.184636  normal  0.609849 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  29.41 
 
 		 1104 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.03 
 
 		 1279 aa  54.3  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  33.88 
 
 		 534 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1986  hypothetical protein  33.64 
 
 		 682 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 		 1424 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1245  NB-ARC domain-containing protein  28.5 
 
 		 848 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3262  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1020 aa  49.3  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3126  hypothetical protein  30.71 
 
 		 383 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000917483  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5261  hypothetical protein  27.68 
 
 		 690 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165104  hitchhiker  0.00234042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6006  hypothetical protein  27.27 
 
 		 610 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2348  hypothetical protein  29.29 
 
 		 254 aa  47.4  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389344  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 1596 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2099  polysaccharide deacetylase  39.71 
 
 		 429 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  29.03 
 
 		 504 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  22.87 
 
 		 840 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  24.14 
 
 		 960 aa  45.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.89 
 
 		 904 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00481  conserved hypothetical protein  25.09 
 
 		 1114 aa  43.9  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  24.45 
 
 		 2159 aa  43.9  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  22.43 
 
 		 845 aa  43.9  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>