More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3901 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3901  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
311 aa  625  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  91.64 
 
 
311 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  55.21 
 
 
305 aa  345  8e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  57.44 
 
 
314 aa  322  7e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  44.75 
 
 
291 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  44.1 
 
 
285 aa  250  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  43.71 
 
 
295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  42.21 
 
 
299 aa  230  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  38.29 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3320  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.31 
 
 
301 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3866  glycosyl transferase family 2  31.85 
 
 
324 aa  129  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0214545  decreased coverage  0.00118676 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0438  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 
298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.599386 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4093  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 
305 aa  125  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2523  fused dolichol-phosphate mannosyltransferase/uncharacterized protein  32.21 
 
 
305 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.49497  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
237 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8187  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 
233 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 
232 aa  123  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
229 aa  122  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0731  family 2 glycosyl transferase  31.35 
 
 
298 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409725  normal  0.0143344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7628  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 
306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2074  glycosyl transferase family 2  31.49 
 
 
327 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5883  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0730  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
364 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578304  normal  0.224353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1368  glycosyl transferase, family 2  27.53 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3775  glycosyl transferase family 2  31.83 
 
 
311 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0748146  normal  0.865798 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0571  glycosyltransferase ycbB  30.17 
 
 
234 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.50645  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  34.76 
 
 
243 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  40.76 
 
 
245 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  38.91 
 
 
245 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  40.76 
 
 
245 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 
250 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  44.65 
 
 
362 aa  103  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 
227 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  37.02 
 
 
340 aa  102  7e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  32.63 
 
 
411 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0090  glycosyl transferase family 2  34.95 
 
 
252 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
293 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5400  glycosyl transferase family 2  31.92 
 
 
242 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  32.27 
 
 
410 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
312 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 
238 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
312 aa  99.8  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4281  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 
335 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 
242 aa  99.8  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
242 aa  99.8  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 
450 aa  99.4  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 
414 aa  99  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  32.83 
 
 
304 aa  99  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 
335 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  34.4 
 
 
355 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
226 aa  98.6  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
227 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  35.61 
 
 
227 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5607  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
242 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
420 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 
229 aa  97.4  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.64 
 
 
410 aa  97.1  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 
228 aa  96.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  31.15 
 
 
313 aa  96.7  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  33.74 
 
 
271 aa  96.7  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
298 aa  96.3  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1612  glycosyl transferase family protein  37.56 
 
 
231 aa  96.3  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
319 aa  95.9  7e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1795  glycosyl transferase family 2  28.86 
 
 
357 aa  95.9  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00120607  normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 
344 aa  95.9  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 
227 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
301 aa  95.5  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
374 aa  94.7  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
393 aa  94.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 
321 aa  93.6  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0148  succinoglycan biosynthesis protein  29.29 
 
 
334 aa  93.6  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
344 aa  93.6  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 
448 aa  93.6  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
237 aa  93.2  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0083  glycosyltransferase  35.14 
 
 
228 aa  93.2  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.413849  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2054  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 
237 aa  92  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4016  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
326 aa  92  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
287 aa  92  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2240  glycosyl transferase family 2  37.69 
 
 
226 aa  91.3  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 
272 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 
230 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 
230 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0752  glycosyl transferase family protein  37.42 
 
 
243 aa  90.9  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000917436  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
586 aa  90.9  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  32.55 
 
 
340 aa  90.5  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  31.68 
 
 
394 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  31.36 
 
 
410 aa  90.1  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  33.52 
 
 
227 aa  90.1  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.27 
 
 
239 aa  89.7  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
340 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2078  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.38 
 
 
327 aa  89.7  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  33.54 
 
 
238 aa  89.7  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 
249 aa  89.4  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
324 aa  88.6  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0757  glycosyl transferase family protein  44.14 
 
 
226 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0445  glycosyl transferase family 2  33.13 
 
 
334 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
236 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
315 aa  88.2  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1658  glycosyl transferase family 2  34.59 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>