212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3862 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  100 
 
 
267 aa  525  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  80.22 
 
 
272 aa  421  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  67.18 
 
 
264 aa  333  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  61.22 
 
 
267 aa  288  5.0000000000000004e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  56.41 
 
 
271 aa  257  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  52.44 
 
 
266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  55.82 
 
 
257 aa  246  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  52.09 
 
 
277 aa  246  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  55.42 
 
 
257 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  54.37 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  58.06 
 
 
252 aa  241  7.999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  56.22 
 
 
276 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0319  hemolysin A  54.66 
 
 
272 aa  238  6.999999999999999e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  55.82 
 
 
367 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  51.6 
 
 
264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  47.57 
 
 
270 aa  232  5e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  51.6 
 
 
264 aa  232  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  48.64 
 
 
267 aa  231  6e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  48.64 
 
 
267 aa  231  6e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  54.72 
 
 
249 aa  230  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  50.81 
 
 
270 aa  229  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  55.08 
 
 
240 aa  228  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6777  hemolysin A  53.85 
 
 
282 aa  228  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  50.6 
 
 
279 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3929  hemolysin A  50.6 
 
 
279 aa  227  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4399  hemolysin A  50.6 
 
 
279 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000782309  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  52 
 
 
277 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4196  hemolysin A  50.6 
 
 
279 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.6643e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  50.6 
 
 
279 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  51.2 
 
 
269 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1222  hemolysin A  57.26 
 
 
260 aa  227  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000687315 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  52.05 
 
 
282 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3918  hemolysin A  50.6 
 
 
279 aa  226  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  49.41 
 
 
272 aa  226  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  54.07 
 
 
279 aa  226  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  57.14 
 
 
264 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4248  hemolysin A  50.2 
 
 
279 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000872961  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4423  hemolysin A  53.28 
 
 
266 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3711  hemolysin A  53.04 
 
 
270 aa  224  8e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  55.92 
 
 
252 aa  224  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4361  hemolysin A  53.28 
 
 
266 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  47.95 
 
 
269 aa  223  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  49.4 
 
 
271 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  49.4 
 
 
271 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0948  hemolysin A  50 
 
 
279 aa  223  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000087786  decreased coverage  0.0000013909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4286  hemolysin A  50 
 
 
279 aa  223  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000449467  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2869  hemolysin A  50 
 
 
279 aa  223  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361209  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  52.05 
 
 
251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3836  hemolysin A  45.79 
 
 
284 aa  222  6e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.63638 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0583  hypothetical protein  47.76 
 
 
270 aa  221  8e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1661  hemolysin A  55.92 
 
 
252 aa  221  8e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0132682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4028  hemolysin A  49.2 
 
 
279 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000205737  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2026  hemolysin A  50.74 
 
 
267 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2200  hemolysin A  51.88 
 
 
268 aa  218  1e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  54.47 
 
 
246 aa  217  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  50 
 
 
268 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  46.39 
 
 
266 aa  216  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1180  hemolysin A  47.01 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000850767  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1420  hemolysin A  56.05 
 
 
227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581192  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0476  hemolysin A  48.33 
 
 
281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763875  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0935  hemolysin A  43.32 
 
 
264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04661  rRNA methyltransferase  49.81 
 
 
267 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  52.42 
 
 
274 aa  211  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4511  hemolysin A  49.03 
 
 
272 aa  209  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1601  rRNA methylase  48.58 
 
 
278 aa  209  5e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  53.31 
 
 
250 aa  209  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  52.89 
 
 
250 aa  208  7e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0901  hemolysin A  48.24 
 
 
269 aa  207  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000212028  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1181  hemolysin, putative  47.55 
 
 
288 aa  207  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0907  hemolysin A  48.87 
 
 
270 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2034  hemolysin A  49.81 
 
 
266 aa  206  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0755  rRNA methylase  46.61 
 
 
270 aa  205  5e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000457361  hitchhiker  0.0000277654 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2013  hemolysin A  51.67 
 
 
269 aa  205  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0478155 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1693  hemolysin A  49.01 
 
 
276 aa  204  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256356  hitchhiker  0.00423085 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15831  rRNA methyltransferase  48.22 
 
 
271 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2583  hemolysin A  47.39 
 
 
269 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.175728 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  45.02 
 
 
268 aa  202  5e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2828  hemolysin A  49.8 
 
 
275 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2383  hemolysin A  49.4 
 
 
271 aa  202  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  49.39 
 
 
242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2834  hemolysin A  52.03 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2951  hemolysin A  48.59 
 
 
269 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.781583  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2995  hemolysin A  48.59 
 
 
269 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0689354  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4828  hemolysin A  52.07 
 
 
249 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2966  hemolysin A  48.59 
 
 
269 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.173623 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0499  hemolysin A  47.6 
 
 
275 aa  199  5e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.298305  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3027  hemolysin A  45.93 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1045  hemolysin A  44.03 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.323407  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1045  hemolysin A  48.39 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.285224  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0042  hemolysin A  51.65 
 
 
246 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0545179  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1902  hemolysin A  47.21 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.485461  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16431  rRNA methyltransferase  42.91 
 
 
270 aa  194  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  48.16 
 
 
247 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1455  hemolysin A  48.8 
 
 
265 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0732885  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1557  hemolysin A  44.4 
 
 
270 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1047  hemolysin A  48.78 
 
 
251 aa  192  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.940085  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16541  rRNA methyltransferase  44 
 
 
270 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.435905  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11709  cytotoxin|haemolysin tlyA  47.79 
 
 
268 aa  193  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.198254  normal  0.144006 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3149  hemolysin A  48.7 
 
 
270 aa  193  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.074979  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16661  rRNA methyltransferase  44 
 
 
270 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.186835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>