More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3844 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3844  cell cycle protein  100 
 
 
443 aa  867  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.090229  hitchhiker  0.000109873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0578  cell cycle protein  90.52 
 
 
443 aa  722  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1306  cell cycle protein  49.78 
 
 
472 aa  357  2e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1647  cell cycle protein  47.61 
 
 
480 aa  342  8e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393395  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0044  cell cycle protein  47.68 
 
 
472 aa  336  5e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1449  cell cycle protein  41.23 
 
 
463 aa  325  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.769758  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1377  cell cycle protein  47.52 
 
 
439 aa  301  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2306  cell cycle protein  40.32 
 
 
426 aa  285  2e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.186468  hitchhiker  0.000727648 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0023  cell cycle protein  40.84 
 
 
429 aa  280  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0910  cell cycle protein  41.16 
 
 
405 aa  271  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.32654  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0137  cell cycle protein  39.86 
 
 
493 aa  272  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882839  decreased coverage  0.000566285 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.68 
 
 
924 aa  271  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.94 
 
 
954 aa  269  7e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0018  cell cycle protein  42.55 
 
 
470 aa  269  9e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0026  cell cycle protein  42.55 
 
 
470 aa  269  9e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462099  hitchhiker  0.00956397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0018  cell cycle protein  42.55 
 
 
470 aa  269  9e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0785065  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  40.84 
 
 
921 aa  266  8e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4433  cell cycle protein  38.64 
 
 
498 aa  259  7e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0080  cell cycle protein  41.27 
 
 
487 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0026  cell cycle protein  39.21 
 
 
470 aa  256  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1712  cell cycle protein  39.21 
 
 
441 aa  255  1e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  40.61 
 
 
933 aa  254  3e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10017  cell division protein rodA  39.18 
 
 
469 aa  253  4e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222067  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  37.69 
 
 
517 aa  253  4e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.545954  normal  0.347866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0809  cell cycle protein  41.6 
 
 
470 aa  247  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0025  cell cycle protein  41.21 
 
 
468 aa  246  5e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0074  cell cycle protein  39.79 
 
 
457 aa  235  1e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0024  cell cycle protein  39.82 
 
 
487 aa  233  4e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0545169  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  37.56 
 
 
463 aa  231  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0030  cell cycle protein  39.55 
 
 
475 aa  231  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36129  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0028  cell cycle protein  37.17 
 
 
533 aa  230  4e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3846  cell cycle protein  38.8 
 
 
428 aa  229  7e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.57616  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3046  cell cycle protein  36.1 
 
 
422 aa  229  8e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000270462  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0052  cell cycle protein  36.87 
 
 
460 aa  229  9e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00121731  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6474  cell cycle protein  34.6 
 
 
529 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0114  cell division protein FtsW  37.56 
 
 
459 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.469585  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0023  cell cycle protein  36.1 
 
 
486 aa  227  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00390  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  38.6 
 
 
543 aa  227  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.476273 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0028  cell cycle protein  36.67 
 
 
476 aa  226  5e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1055  cell cycle protein  35.32 
 
 
414 aa  226  8e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.72052e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0021  cell cycle protein  39.01 
 
 
496 aa  226  9e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0021  cell cycle protein  42.05 
 
 
459 aa  225  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0173  cell cycle protein  36.4 
 
 
563 aa  225  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.821251 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0023  cell cycle protein  36.94 
 
 
462 aa  221  2e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000166651 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0033  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  32.65 
 
 
493 aa  220  4e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00780  cell division protein RodA  38.27 
 
 
474 aa  219  7e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1380  cell division membrane protein  34.38 
 
 
519 aa  218  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0038  cell cycle protein  38.16 
 
 
473 aa  217  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0045  cell cycle protein  35.31 
 
 
496 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380495  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0331  cell cycle protein FtsW  36.46 
 
 
409 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0339  cell cycle protein FtsW  36.46 
 
 
409 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5249  cell cycle protein  36.86 
 
 
469 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168107 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26960  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  37.39 
 
 
463 aa  203  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.538184  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0066  cell cycle protein  34.52 
 
 
517 aa  201  2e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0015  cell cycle protein  35.19 
 
 
435 aa  197  2e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2477  cell cycle protein  33.43 
 
 
399 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0050  cell cycle protein  34.23 
 
 
496 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0875  cell cycle protein  34.35 
 
 
422 aa  196  9e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0029  cell cycle protein  39.95 
 
 
494 aa  196  9e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1003  cell cycle protein  38.8 
 
 
444 aa  188  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  39.51 
 
 
423 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  38.93 
 
 
374 aa  175  1e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  34.16 
 
 
363 aa  175  1e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  32.98 
 
 
368 aa  174  2e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3063  FtsW/RodA/SpoVE family cell cycle protein  34.94 
 
 
480 aa  174  3e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00913088  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  39.64 
 
 
420 aa  173  4e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0036  cell cycle protein  30.81 
 
 
659 aa  173  6e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  39.43 
 
 
364 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  38.21 
 
 
374 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  31.9 
 
 
368 aa  170  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  37.41 
 
 
367 aa  170  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  35.88 
 
 
371 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  33.57 
 
 
972 aa  165  2e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  38.33 
 
 
365 aa  164  4e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  32.28 
 
 
367 aa  163  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  31.73 
 
 
412 aa  163  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  35.59 
 
 
375 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5099  cell division protein FtsW  33.05 
 
 
474 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102633  normal  0.0547084 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0427  cell division membrane protein  35.96 
 
 
481 aa  159  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3070  cell cycle protein FtsW  35.82 
 
 
354 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  34.91 
 
 
377 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2851  cell division protein FtsW  36.81 
 
 
424 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4985  cell division protein FtsW  35.99 
 
 
399 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348028  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2010  stage V sporulation protein E  37.23 
 
 
368 aa  156  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57360  cell division protein FtsW  35.99 
 
 
399 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  34.98 
 
 
374 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2927  cell division protein FtsW  35.56 
 
 
417 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  31.88 
 
 
380 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  33.43 
 
 
378 aa  153  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  5.11075e-11  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0754  cell division protein FtsW  32.18 
 
 
375 aa  152  9e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.138938  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  34.78 
 
 
359 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1414  cell cycle protein  34.1 
 
 
530 aa  152  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00165881  normal  0.0788928 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1980  cell division protein FtsW  33.23 
 
 
398 aa  151  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0768  cell division protein FtsW  38.65 
 
 
400 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.626093  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08840  cell division membrane protein  34.72 
 
 
479 aa  150  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  2.21813e-09 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2538  cell division protein ftsW  35.02 
 
 
391 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2668  cell division protein ftsW  35.02 
 
 
391 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  34.69 
 
 
386 aa  150  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2092  cell division protein FtsW  37.72 
 
 
395 aa  149  8e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4674  cell cycle protein  35.16 
 
 
405 aa  149  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000737984  normal  0.479047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>