138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3833 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0101  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
352 aa  735    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000553926  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0157  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
352 aa  735    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00114927  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0247  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
352 aa  735    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186858  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0302  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
352 aa  735    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0539  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
352 aa  735    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0478326  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0635  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
352 aa  735    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000109907  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0751  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
352 aa  735    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000459793  hitchhiker  0.00109121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0834  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
352 aa  735    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000820934  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1221  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
352 aa  735    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000020949  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1383  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
352 aa  735    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000158375  hitchhiker  0.00331132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1477  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
352 aa  735    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136224  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1873  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
352 aa  735    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00916179  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2345  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
352 aa  735    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2390  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
352 aa  735    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.082083  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3274  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
352 aa  735    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000259909  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3382  transposase, IS4 family protein  99.72 
 
 
352 aa  733    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000182437  hitchhiker  0.00538438 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3389  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
352 aa  735    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141638  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3833  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
352 aa  735    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4033  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
352 aa  735    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000656142  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4083  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
352 aa  735    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0538175  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4095  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
352 aa  735    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00617588  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0445  hypothetical protein  92.54 
 
 
153 aa  266  5e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000109917  normal  0.0348791 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3108  transposase, IS4 family protein  32.54 
 
 
298 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.202313  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5439  transposase, IS4 family protein  32.54 
 
 
298 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.948366  normal  0.697595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2980  transposase, IS4 family protein  32.54 
 
 
298 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528194  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2904  transposase, IS4 family protein  32.54 
 
 
298 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.167457  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2666  transposase, IS4 family protein  32.25 
 
 
298 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1316  hypothetical protein  28.74 
 
 
275 aa  124  3e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0586  hypothetical protein  28.44 
 
 
275 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1056  hypothetical protein  28.44 
 
 
275 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.776166 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1117  hypothetical protein  28.44 
 
 
275 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.281575 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1388  hypothetical protein  28.44 
 
 
275 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0575  hypothetical protein  27.84 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0448  hypothetical protein  26.95 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1717  hypothetical protein  28.57 
 
 
249 aa  113  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0553  hypothetical protein  28.48 
 
 
272 aa  113  6e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000297126 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1780  hypothetical protein  27.67 
 
 
255 aa  110  5e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.170246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1652  hypothetical protein  27.67 
 
 
255 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1845  hypothetical protein  27.67 
 
 
255 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.072763 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1848  hypothetical protein  28.3 
 
 
255 aa  106  7e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.278285 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1953  hypothetical protein  28.3 
 
 
255 aa  106  7e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1904  hypothetical protein  28.3 
 
 
255 aa  105  9e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1478  hypothetical protein  28.3 
 
 
255 aa  105  9e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1566  hypothetical protein  28.3 
 
 
255 aa  105  9e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.706512 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1451  hypothetical protein  27.98 
 
 
276 aa  105  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1055  hypothetical protein  27.36 
 
 
260 aa  101  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.719775 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1738  hypothetical protein  28.81 
 
 
238 aa  101  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0992  hypothetical protein  40.91 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.160605 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2719  transposase, IS4  28.36 
 
 
335 aa  88.6  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0844  transposase, IS4  28.36 
 
 
335 aa  88.6  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2007  transposase, IS4  28.36 
 
 
335 aa  88.6  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2191  transposase, IS4  28.36 
 
 
335 aa  88.6  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00429854  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2197  transposase, IS4  28.36 
 
 
335 aa  88.6  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.151302  normal  0.432769 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3998  transposase IS4 family protein  34.36 
 
 
330 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.936771 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1566  transposase IS4 family protein  34.36 
 
 
330 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2557  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4523  transposase IS4 family protein  34.36 
 
 
330 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0208  transposase IS4 family protein  34.36 
 
 
330 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000590832 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3330  transposase IS4 family protein  34.36 
 
 
330 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4007  transposase IS4 family protein  33.74 
 
 
330 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4509  transposase IS4 family protein  33.74 
 
 
330 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2986  transposase IS4 family protein  33.74 
 
 
330 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2882  transposase IS4 family protein  33.74 
 
 
330 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4258  transposase IS4 family protein  33.74 
 
 
330 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1051  IS4 family transposase  33.95 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3399  transposase IS4 family protein  32 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1269  transposase IS4 family protein  34.06 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1490  hypothetical protein  26.67 
 
 
200 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1999  transposase IS4 family protein  26.55 
 
 
324 aa  63.2  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0143016  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3862  hypothetical protein  23.02 
 
 
273 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5812  transposase IS5 family protein  23.02 
 
 
247 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5798  transposase IS5 family protein  23.02 
 
 
247 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3899  transposase IS702 family protein  23.02 
 
 
247 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2602  transposase IS4 family protein  22.73 
 
 
309 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159283  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1206  transposase IS4 family protein  22.73 
 
 
309 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2498  IS1381, transposase orfB  33.04 
 
 
113 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3588  hypothetical protein  29.19 
 
 
166 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  38.64 
 
 
355 aa  57  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4879  hypothetical protein  29.19 
 
 
166 aa  56.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3594  hypothetical protein  29.19 
 
 
166 aa  56.2  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0961  transposase, IS4  29.93 
 
 
249 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0578745  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3646  transposase, IS4 family  30.15 
 
 
260 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0120  response regulator receiver protein  29.05 
 
 
244 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0143  response regulator receiver protein  29.93 
 
 
257 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1783  response regulator receiver protein  29.93 
 
 
257 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.138367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2062  response regulator receiver protein  29.93 
 
 
257 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2531  response regulator receiver protein  29.93 
 
 
257 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4843  hypothetical protein  28.67 
 
 
157 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3041  transposase IS4 family protein  30.23 
 
 
260 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3105  transposase IS4 family protein  30.23 
 
 
260 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.297989  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4832  hypothetical protein  28.85 
 
 
157 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.870772  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2094  IS4 family transposase  30.86 
 
 
174 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.204106 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2371  transposase  31.34 
 
 
122 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0905863  normal  0.352426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4558  transposase IS4 family protein  30.22 
 
 
274 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1521  hypothetical protein  32.65 
 
 
99 aa  50.4  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.866881 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1527  hypothetical protein  32.65 
 
 
99 aa  50.4  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.524444 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1636  hypothetical protein  32.65 
 
 
99 aa  50.8  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1998  transposase IS4 family protein  29.41 
 
 
259 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0111459 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1819  hypothetical protein  29.41 
 
 
102 aa  50.1  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.534462 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0173  hypothetical protein  31.25 
 
 
243 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.372645  normal  0.496581 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2546  transposase  29.32 
 
 
277 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>