195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3819 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  100 
 
 		 391 aa  794    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  84.14 
 
 		 391 aa  669    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  59.58 
 
 		 390 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  47.92 
 
 		 382 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  47.92 
 
 		 382 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  47.92 
 
 		 382 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  47.92 
 
 		 382 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  48.82 
 
 		 382 aa  355  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  48.82 
 
 		 382 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  48.56 
 
 		 382 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  48.56 
 
 		 382 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  47.66 
 
 		 382 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  48.29 
 
 		 382 aa  352  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  47.66 
 
 		 382 aa  353  4e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  48.4 
 
 		 382 aa  352  5e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  46.93 
 
 		 398 aa  351  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  49.07 
 
 		 405 aa  351  1e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  47.14 
 
 		 382 aa  351  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  47.51 
 
 		 386 aa  348  7e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  47.77 
 
 		 386 aa  346  3e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  46.81 
 
 		 403 aa  345  7e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  52.38 
 
 		 383 aa  345  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  47.26 
 
 		 387 aa  343  4e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  49.07 
 
 		 383 aa  342  5e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  49.2 
 
 		 383 aa  342  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  49.2 
 
 		 383 aa  342  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  49.2 
 
 		 383 aa  342  8e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  49.73 
 
 		 383 aa  341  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  46.42 
 
 		 385 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  49.47 
 
 		 387 aa  339  5.9999999999999996e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  49.45 
 
 		 389 aa  335  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  45.88 
 
 		 404 aa  330  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  43.31 
 
 		 379 aa  320  3e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  42.56 
 
 		 385 aa  315  6e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  42.71 
 
 		 389 aa  313  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  44.56 
 
 		 393 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  50.42 
 
 		 376 aa  310  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  44.3 
 
 		 409 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  44.56 
 
 		 385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  42.07 
 
 		 394 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  46.74 
 
 		 414 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  48.28 
 
 		 387 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  42.09 
 
 		 385 aa  302  7.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  47.48 
 
 		 387 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  41.22 
 
 		 386 aa  298  2e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  41.19 
 
 		 387 aa  296  5e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  41.95 
 
 		 384 aa  295  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  46.33 
 
 		 349 aa  291  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  41.64 
 
 		 388 aa  290  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  41.11 
 
 		 388 aa  290  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  42.93 
 
 		 405 aa  287  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  40.16 
 
 		 397 aa  286  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  40.79 
 
 		 389 aa  286  5e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  38.34 
 
 		 387 aa  285  7e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  38.3 
 
 		 387 aa  285  7e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  46.05 
 
 		 359 aa  285  8e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  38.34 
 
 		 387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  39.12 
 
 		 388 aa  282  6.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  40.21 
 
 		 388 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  37.19 
 
 		 395 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  37.79 
 
 		 388 aa  281  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  39.34 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  36.36 
 
 		 386 aa  276  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  40.37 
 
 		 396 aa  275  8e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  44.44 
 
 		 369 aa  273  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  37.92 
 
 		 386 aa  271  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  44.17 
 
 		 358 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  42.02 
 
 		 392 aa  266  4e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  38.78 
 
 		 412 aa  265  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  37.43 
 
 		 380 aa  264  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  40.94 
 
 		 392 aa  263  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  37.98 
 
 		 390 aa  263  4e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  40.53 
 
 		 381 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  39.73 
 
 		 389 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  40.53 
 
 		 381 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  40.53 
 
 		 381 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  40.53 
 
 		 381 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  41.01 
 
 		 372 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1371  galactokinase  39.23 
 
 		 388 aa  259  4e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  36.94 
 
 		 384 aa  259  5.0000000000000005e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  38.63 
 
 		 350 aa  259  8e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  38.63 
 
 		 350 aa  259  8e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  38.99 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  37.94 
 
 		 355 aa  258  1e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  35.96 
 
 		 383 aa  256  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  38.2 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  39.11 
 
 		 381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  38.46 
 
 		 381 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  38.46 
 
 		 381 aa  252  6e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  34.62 
 
 		 392 aa  253  6e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  39.02 
 
 		 394 aa  249  4e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0544  galactokinase  43.54 
 
 		 380 aa  249  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  43.23 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  42.07 
 
 		 356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2244  galactokinase  37.11 
 
 		 399 aa  245  8e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  35.77 
 
 		 392 aa  245  9e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  35.14 
 
 		 399 aa  244  3e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  43.58 
 
 		 373 aa  239  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3451  galactokinase  41.43 
 
 		 440 aa  239  8e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1069  galactokinase  36.57 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>