More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3808 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 385 aa  776    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  93.25 
 
 		 385 aa  738    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  69.55 
 
 		 385 aa  548  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  64.75 
 
 		 385 aa  517  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  51.21 
 
 		 378 aa  320  3e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  47.14 
 
 		 378 aa  309  5e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  39.67 
 
 		 386 aa  268  8e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 		 390 aa  249  4e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  41.94 
 
 		 385 aa  247  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  40.26 
 
 		 388 aa  239  6.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  37.7 
 
 		 383 aa  226  4e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  37.91 
 
 		 392 aa  225  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  36.18 
 
 		 382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  36.01 
 
 		 381 aa  221  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  35.81 
 
 		 378 aa  219  7e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 		 395 aa  206  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  35.22 
 
 		 382 aa  202  8e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  35.75 
 
 		 496 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  35.49 
 
 		 500 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  35.49 
 
 		 500 aa  199  9e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  36.11 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 394 aa  198  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  35.49 
 
 		 492 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  35.13 
 
 		 394 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  34.87 
 
 		 394 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 		 816 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  35.86 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 823 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 		 816 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 		 394 aa  172  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 391 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 		 799 aa  169  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 		 387 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 		 825 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  37.06 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  34.05 
 
 		 843 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 		 405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  36.78 
 
 		 390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  37.54 
 
 		 390 aa  163  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2867  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.49 
 
 		 418 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 376 aa  159  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2808  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.49 
 
 		 390 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.64 
 
 		 390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0571  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.64 
 
 		 418 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2435  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.64 
 
 		 390 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0467125  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2845  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.64 
 
 		 433 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.64 
 
 		 390 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  31.81 
 
 		 827 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 		 806 aa  155  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 		 395 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 806 aa  152  8e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2677  FAD dependent oxidoreductase  35.42 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  34.93 
 
 		 390 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2994  FAD dependent oxidoreductase  34.73 
 
 		 390 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.33 
 
 		 390 aa  150  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  35.15 
 
 		 390 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  35.15 
 
 		 390 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 805 aa  149  7e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0939  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 797 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  31.33 
 
 		 831 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 816 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 815 aa  146  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4046  FAD dependent oxidoreductase  35.26 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 		 817 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02147  hypothetical protein  33.33 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3475  FAD dependent oxidoreductase  35.33 
 
 		 390 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 		 399 aa  143  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 		 815 aa  143  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  31.36 
 
 		 822 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 		 826 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 831 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 815 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 819 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 827 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 815 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 		 376 aa  137  4e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 806 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  31.67 
 
 		 802 aa  133  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2727  dimethylglycine dehydrogenase  29.07 
 
 		 879 aa  132  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 801 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 812 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 		 398 aa  127  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 804 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3472  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 413 aa  123  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2104  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2224  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175364  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.78 
 
 		 417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.07 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>