More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3778 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3778  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
313 aa  623  1e-177  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00382948  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  81.94 
 
 
312 aa  483  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000544385  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.33 
 
 
301 aa  366  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3519  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.15 
 
 
337 aa  316  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0320  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.94 
 
 
349 aa  301  1e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000221131  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0404  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.34 
 
 
313 aa  297  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0341  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.3 
 
 
349 aa  295  8e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000642562  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_282  S-adenosyl-methyltransferase  51.62 
 
 
349 aa  294  2e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000442175  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3077  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.7 
 
 
311 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.65 
 
 
312 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3982  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.48 
 
 
303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0975  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.4 
 
 
296 aa  279  3e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000346551  normal  0.234872 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1572  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.12 
 
 
291 aa  279  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0667  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.15 
 
 
313 aa  276  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3463  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.47 
 
 
319 aa  276  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3297  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.45 
 
 
313 aa  276  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1046  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.74 
 
 
311 aa  275  9e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3196  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.9 
 
 
305 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.421638  decreased coverage  0.00000374346 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0963  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.32 
 
 
361 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0178075 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1616  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.52 
 
 
304 aa  270  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.41 
 
 
313 aa  269  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1884  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.25 
 
 
310 aa  269  5e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1034  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.71 
 
 
325 aa  269  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0787  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.28 
 
 
309 aa  268  1e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0483  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.32 
 
 
312 aa  267  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2479  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.81 
 
 
317 aa  267  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00084637  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0733  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.68 
 
 
323 aa  265  5e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0144586  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3751  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.67 
 
 
294 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4071  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.12 
 
 
310 aa  264  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1012  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.31 
 
 
310 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.15 
 
 
299 aa  264  2e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417254  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.76 
 
 
316 aa  263  3e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.15 
 
 
299 aa  263  3e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00424727  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0163  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50 
 
 
299 aa  262  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0366877 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3971  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.51 
 
 
310 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000219611  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3964  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.18 
 
 
310 aa  260  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0738  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.1 
 
 
332 aa  260  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0462605  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2086  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.02 
 
 
334 aa  260  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.926608 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0835  methyltransferase  50.48 
 
 
318 aa  260  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.591389 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1985  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.61 
 
 
308 aa  258  7e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000115812  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2568  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.86 
 
 
310 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3745  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.53 
 
 
310 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.627703  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3677  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.86 
 
 
310 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0595  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.51 
 
 
322 aa  258  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835578  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3933  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.86 
 
 
310 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0745363 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4057  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.86 
 
 
310 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1444  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.3 
 
 
324 aa  258  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0770792  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4019  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.53 
 
 
310 aa  257  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.219657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.86 
 
 
310 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0678  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.84 
 
 
313 aa  256  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1222  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.53 
 
 
310 aa  256  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000949855  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2210  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  50.16 
 
 
314 aa  255  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0172475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3660  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.53 
 
 
310 aa  255  7e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2795  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.15 
 
 
312 aa  255  9e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000553872  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2614  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.42 
 
 
320 aa  253  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.624613  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4816  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.58 
 
 
283 aa  253  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1852  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.16 
 
 
345 aa  253  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2119  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.37 
 
 
310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1833  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.37 
 
 
310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0766  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.36 
 
 
308 aa  252  7e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6182  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.49 
 
 
331 aa  251  9.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09010  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.63 
 
 
311 aa  251  9.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2017  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.23 
 
 
308 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1296  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.12 
 
 
315 aa  251  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2271  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.2 
 
 
333 aa  251  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0770  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.65 
 
 
307 aa  250  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.910807  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4056  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.56 
 
 
332 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00662143  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0981  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.13 
 
 
313 aa  248  8e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.575492  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1997  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.97 
 
 
283 aa  247  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.983308  normal  0.573092 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2038  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.15 
 
 
301 aa  247  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57450  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.42 
 
 
313 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2530  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.43 
 
 
332 aa  246  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.475863  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.35 
 
 
311 aa  245  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1238  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.35 
 
 
311 aa  245  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0914  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.4 
 
 
314 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0650  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.23 
 
 
520 aa  244  9.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0921  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.18 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1105  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.45 
 
 
327 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4200  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.83 
 
 
304 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1331  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.21 
 
 
293 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4161  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.83 
 
 
304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0047  methyltransferase  46.71 
 
 
328 aa  243  3e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.509185  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4992  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.62 
 
 
313 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1991  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.04 
 
 
307 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105239  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0958  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.1 
 
 
326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1787  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47 
 
 
294 aa  243  3.9999999999999997e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2460  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.08 
 
 
319 aa  242  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1207  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.07 
 
 
306 aa  242  5e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0205  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.04 
 
 
307 aa  242  7e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1668  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.51 
 
 
316 aa  242  7e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1329  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.93 
 
 
315 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0975  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.51 
 
 
308 aa  241  7.999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0945  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.51 
 
 
308 aa  241  7.999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1986  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.23 
 
 
337 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376194  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0936  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.28 
 
 
315 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4395  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.6 
 
 
315 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216905  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_002978  WD0170  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.04 
 
 
314 aa  240  2.9999999999999997e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.225843  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5104  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.91 
 
 
353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131212  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4681  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.6 
 
 
315 aa  239  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0559  methyltransferase  45.93 
 
 
314 aa  239  4e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000972435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>