116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3750 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  238  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  76.53 
 
 		 104 aa  154  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  68 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  56.7 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0984  hypothetical protein  46.07 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0693423  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0875  hypothetical protein  44.94 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00646034  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  51.19 
 
 		 93 aa  81.3  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  42.35 
 
 		 88 aa  77.8  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0911  protein of unknown function DUF448  49.33 
 
 		 100 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  48.1 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  42.17 
 
 		 88 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  51.47 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  58.9 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  50 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  43.48 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  38.03 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  49.3 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  47.62 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  39.02 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  39.47 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  39.44 
 
 		 90 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1474  protein of unknown function DUF448  45.83 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00145328  unclonable  0.00000273772 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2045  protein of unknown function DUF448  43.37 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  45.45 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  45.07 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  36.23 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1331  hypothetical protein  44.62 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014271  hitchhiker  0.0000760943 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3666  hypothetical protein  46.15 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000614384  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3556  hypothetical protein  46.15 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000244888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3574  hypothetical protein  46.15 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000033301  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1942  hypothetical protein  38.81 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3913  hypothetical protein  46.15 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3853  hypothetical protein  46.15 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000207203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3952  hypothetical protein  46.15 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000117603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3862  hypothetical protein  46.15 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000195024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3827  hypothetical protein  46.15 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33695e-63 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1660  hypothetical protein  37.31 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1442  protein of unknown function DUF448  46.3 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0162227  normal  0.205781 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2467  hypothetical protein  46.15 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893193  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3637  hypothetical protein  43.08 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000118018  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  46.15 
 
 		 110 aa  63.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1369  hypothetical protein  43.59 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.101372  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1153  protein of unknown function DUF448  41.56 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421176  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0812  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  36.59 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00180555  hitchhiker  0.00771974 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10310  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  43.66 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.277899  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23460  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  37.38 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.0432341 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  43.28 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  35.71 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1811  protein of unknown function DUF448  40 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.391163  normal  0.635855 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0834  hypothetical protein  35.29 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0379  hypothetical protein  39.02 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1327  hypothetical protein  31.58 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1353  hypothetical protein  31.58 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  40.79 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08050  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  43.84 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.241726  normal  0.0903759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3854  protein of unknown function DUF448  41.03 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.785086  normal  0.0743558 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  40 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  36.17 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3191  hypothetical protein  45.71 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0484854  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  36.25 
 
 		 212 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1235  hypothetical protein  43.75 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000252033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0381  hypothetical protein  35.29 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1050  protein of unknown function DUF448  36.23 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103013  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0777  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  47.69 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.894427  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4040  hypothetical protein  38.82 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434499  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0697  hypothetical protein  33.8 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302892  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1060  hypothetical protein  42.17 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0185112  normal  0.0579872 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  39.44 
 
 		 203 aa  51.2  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2081  hypothetical protein  39.51 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2127  hypothetical protein  39.51 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144756  decreased coverage  0.00998453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2064  hypothetical protein  39.51 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2313  hypothetical protein  35.63 
 
 		 120 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13241  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04141  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  43.55 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0496  protein of unknown function DUF448  53.85 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.85619 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  33.78 
 
 		 205 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0431  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  30.38 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.219386  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16151  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  39.33 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2490  protein of unknown function DUF448  35.56 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1140  hypothetical protein  43.75 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0164811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7743  protein of unknown function DUF448  46.88 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2080  hypothetical protein  43.55 
 
 		 92 aa  47.8  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.567469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2317  protein of unknown function DUF448  37.93 
 
 		 179 aa  47.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000982991  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1181  hypothetical protein  38.2 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0245041  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1415  hypothetical protein  40 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00199803  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0593  hypothetical protein  39.53 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  39.06 
 
 		 205 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0815  hypothetical protein  36.73 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.183473  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2514  hypothetical protein  45.76 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31832  predicted protein  31.82 
 
 		 317 aa  44.7  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.485373 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2698  hypothetical protein  34.94 
 
 		 247 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.430127  normal  0.265509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2924  protein of unknown function DUF448  34.94 
 
 		 247 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3562  hypothetical protein  35.71 
 
 		 212 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2021  hypothetical protein  39.51 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.158983 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1357  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  35.94 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16971  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  26.67 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0208572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  35.94 
 
 		 197 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14560  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  38.24 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00191039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0060  protein of unknown function DUF448  43.64 
 
 		 81 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16841  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  26.67 
 
 		 90 aa  42.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0341697  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28256  predicted protein  38.04 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0473173 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>