More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3714 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3537  2-alkenal reductase  82.52 
 
 		 387 aa  636    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3714  2-alkenal reductase  100 
 
 		 389 aa  764    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  42.2 
 
 		 412 aa  257  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  40.92 
 
 		 413 aa  256  7e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0347  2-alkenal reductase  44.29 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000181204  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2913  2-alkenal reductase  45.74 
 
 		 393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0108818  normal  0.221837 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  45.88 
 
 		 500 aa  233  3e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.64 
 
 		 381 aa  228  9e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  37.08 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  45.79 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  39.38 
 
 		 513 aa  219  8.999999999999998e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  41.19 
 
 		 411 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  45.02 
 
 		 535 aa  218  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  42.22 
 
 		 389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  38.18 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  43.8 
 
 		 476 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  45.45 
 
 		 475 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  43.86 
 
 		 476 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  46.15 
 
 		 464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  38.48 
 
 		 402 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  41.55 
 
 		 449 aa  212  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  43.86 
 
 		 476 aa  212  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  42.57 
 
 		 464 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.91 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.12 
 
 		 415 aa  211  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.4 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  42.19 
 
 		 478 aa  210  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  44 
 
 		 511 aa  210  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  40.8 
 
 		 450 aa  211  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  40.8 
 
 		 450 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  40.8 
 
 		 450 aa  211  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.34 
 
 		 384 aa  210  4e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  35.28 
 
 		 502 aa  209  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  40.57 
 
 		 453 aa  209  5e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  42.27 
 
 		 453 aa  209  6e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.49 
 
 		 386 aa  209  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  40.52 
 
 		 451 aa  209  7e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  41.97 
 
 		 385 aa  209  8e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  41.41 
 
 		 497 aa  208  1e-52  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  40.23 
 
 		 450 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  40.23 
 
 		 450 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  40.23 
 
 		 450 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  40.71 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  40.24 
 
 		 457 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  40.86 
 
 		 450 aa  208  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  39.48 
 
 		 450 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.44 
 
 		 428 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  36.55 
 
 		 408 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  38.75 
 
 		 469 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  39.44 
 
 		 451 aa  206  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  40.34 
 
 		 455 aa  206  5e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  39.81 
 
 		 395 aa  206  6e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  37.75 
 
 		 415 aa  206  6e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  39.94 
 
 		 450 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  42.18 
 
 		 588 aa  205  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  42.6 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  42.46 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  36.41 
 
 		 408 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  41.55 
 
 		 449 aa  205  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  38.77 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  35.93 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  41.82 
 
 		 578 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  39.88 
 
 		 506 aa  204  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  37.44 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  35.93 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  41.01 
 
 		 509 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  38.57 
 
 		 450 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40 
 
 		 387 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  45 
 
 		 485 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  44.94 
 
 		 471 aa  203  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0220  protease Do  39.66 
 
 		 481 aa  203  4e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.850727  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  38.18 
 
 		 424 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  40.73 
 
 		 473 aa  203  5e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  35.43 
 
 		 467 aa  203  5e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  44 
 
 		 461 aa  202  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  40.94 
 
 		 528 aa  202  8e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0250  heat shock protein  44.04 
 
 		 481 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  43.23 
 
 		 348 aa  202  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  40.24 
 
 		 504 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  41.05 
 
 		 453 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  46.15 
 
 		 472 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  43.43 
 
 		 477 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  40.84 
 
 		 472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  40.55 
 
 		 458 aa  200  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3918  protease Do  41.58 
 
 		 508 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  38.68 
 
 		 450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  42.91 
 
 		 473 aa  199  5e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  37.43 
 
 		 462 aa  199  5e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  45.79 
 
 		 498 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  41.24 
 
 		 396 aa  199  6e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  39.09 
 
 		 502 aa  199  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.91 
 
 		 375 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  39.94 
 
 		 456 aa  199  9e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  41.22 
 
 		 464 aa  199  9e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  42.5 
 
 		 446 aa  199  9e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  42.05 
 
 		 508 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  42.46 
 
 		 476 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  37.16 
 
 		 452 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  39.83 
 
 		 455 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  42.55 
 
 		 495 aa  198  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>