More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3677 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 167 aa  342  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  97.01 
 
 		 167 aa  334  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  81.93 
 
 		 174 aa  295  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  76.19 
 
 		 179 aa  277  6e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  65.43 
 
 		 271 aa  229  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  66.23 
 
 		 216 aa  226  9e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  63.58 
 
 		 264 aa  226  9e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.23 
 
 		 226 aa  223  7e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  64.74 
 
 		 183 aa  223  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  65.56 
 
 		 182 aa  223  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  71.83 
 
 		 180 aa  223  1e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  66.23 
 
 		 199 aa  222  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  64.74 
 
 		 185 aa  221  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  64.74 
 
 		 184 aa  222  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  66.89 
 
 		 226 aa  220  6e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.2 
 
 		 181 aa  220  7e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  66.89 
 
 		 226 aa  220  9e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  64.47 
 
 		 182 aa  218  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  62.18 
 
 		 183 aa  218  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.46 
 
 		 183 aa  217  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.9 
 
 		 183 aa  217  7e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.18 
 
 		 184 aa  216  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.73 
 
 		 183 aa  216  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 		 184 aa  216  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 		 184 aa  216  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  58.79 
 
 		 184 aa  215  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.1 
 
 		 184 aa  215  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.66 
 
 		 179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  63.82 
 
 		 183 aa  214  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  61.39 
 
 		 179 aa  214  4e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  61.54 
 
 		 184 aa  214  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  58.18 
 
 		 184 aa  213  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  60.9 
 
 		 184 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.39 
 
 		 183 aa  213  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  62.5 
 
 		 184 aa  212  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.91 
 
 		 184 aa  212  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  63.51 
 
 		 178 aa  211  3.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.29 
 
 		 170 aa  206  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  59.62 
 
 		 213 aa  204  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.06 
 
 		 170 aa  202  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.06 
 
 		 170 aa  202  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.09 
 
 		 202 aa  202  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  58.82 
 
 		 170 aa  201  5e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  61.18 
 
 		 170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  60.67 
 
 		 172 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  60.67 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  60.67 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  60.67 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  56.21 
 
 		 170 aa  197  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  60.67 
 
 		 172 aa  197  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  60.67 
 
 		 172 aa  197  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  60.67 
 
 		 172 aa  197  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  60.67 
 
 		 172 aa  197  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  60.67 
 
 		 172 aa  197  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  60.67 
 
 		 172 aa  197  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  62.07 
 
 		 172 aa  197  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  63.38 
 
 		 170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  59.87 
 
 		 173 aa  195  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.96 
 
 		 183 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.5 
 
 		 200 aa  195  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  54 
 
 		 792 aa  194  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  59.72 
 
 		 159 aa  194  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  61.11 
 
 		 167 aa  195  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  59.72 
 
 		 159 aa  194  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  53.59 
 
 		 168 aa  195  3e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.82 
 
 		 200 aa  194  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  63.38 
 
 		 166 aa  194  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  54.93 
 
 		 793 aa  193  9e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0744  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.78 
 
 		 191 aa  193  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167949 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  52.98 
 
 		 791 aa  193  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.52 
 
 		 169 aa  192  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  58.33 
 
 		 159 aa  192  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  58.33 
 
 		 159 aa  192  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  53.19 
 
 		 794 aa  191  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.06 
 
 		 176 aa  191  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.33 
 
 		 200 aa  191  4e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  56.94 
 
 		 159 aa  191  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.79 
 
 		 176 aa  189  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  52.48 
 
 		 794 aa  190  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  56.85 
 
 		 173 aa  189  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  57.79 
 
 		 158 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1358  NADH dehydrogenase subunit B  55.94 
 
 		 213 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.14 
 
 		 159 aa  187  7e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0485  NADH dehydrogenase subunit B  54 
 
 		 171 aa  187  8e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  56.49 
 
 		 158 aa  187  8e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  56.49 
 
 		 158 aa  186  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0962  NADH dehydrogenase subunit B  57.64 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0673529  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  58.33 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1444  NADH dehydrogenase subunit B  51.81 
 
 		 165 aa  186  1e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0432732  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  58.33 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.14 
 
 		 251 aa  186  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  55.77 
 
 		 184 aa  186  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.09 
 
 		 169 aa  186  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  56.49 
 
 		 158 aa  186  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1131  NADH dehydrogenase subunit B  57.64 
 
 		 159 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336048  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1300  NADH dehydrogenase subunit B  57.64 
 
 		 159 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2272  NADH dehydrogenase subunit B  57.64 
 
 		 159 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000536448  normal  0.140602 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1062  NADH dehydrogenase subunit B  57.64 
 
 		 173 aa  185  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0102283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2248  NADH dehydrogenase subunit B  57.64 
 
 		 159 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00315965  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2165  NADH dehydrogenase subunit B  57.64 
 
 		 159 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00589075  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>