More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3675 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  100 
 
 		 417 aa  852    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  79.61 
 
 		 411 aa  681    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  97.84 
 
 		 417 aa  832    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  68.04 
 
 		 422 aa  595  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  59.13 
 
 		 390 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  57.07 
 
 		 389 aa  481  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  56.52 
 
 		 390 aa  481  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  57.07 
 
 		 389 aa  481  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  57.76 
 
 		 401 aa  479  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  55.53 
 
 		 390 aa  471  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  56.04 
 
 		 390 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4062  NADH dehydrogenase subunit D  55.28 
 
 		 441 aa  464  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.855736  normal  0.069193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4460  NADH dehydrogenase subunit D  55.77 
 
 		 441 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0270  NADH dehydrogenase subunit D  55.77 
 
 		 440 aa  455  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.877752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  56.56 
 
 		 414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0541  NADH dehydrogenase subunit D  55.26 
 
 		 482 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.482391  normal  0.20204 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  55.5 
 
 		 415 aa  450  1e-125  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1277  NADH dehydrogenase I, D subunit  54.81 
 
 		 444 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494921  normal  0.687145 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0284  NADH dehydrogenase I subunit D  52.42 
 
 		 438 aa  448  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  56.81 
 
 		 403 aa  448  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6091  NADH dehydrogenase subunit D  55.26 
 
 		 457 aa  445  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489458  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.35 
 
 		 417 aa  444  1e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1152  NADH dehydrogenase I, D subunit  53.12 
 
 		 413 aa  434  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  50.24 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  54.71 
 
 		 400 aa  431  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4415  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.28 
 
 		 449 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0398  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.83 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0711  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.44 
 
 		 417 aa  428  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0977  NADH dehydrogenase subunit D  52.1 
 
 		 459 aa  429  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  50.24 
 
 		 417 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  50.48 
 
 		 417 aa  428  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  50.24 
 
 		 417 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  50.24 
 
 		 417 aa  426  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  50.96 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  50.96 
 
 		 417 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  50.24 
 
 		 417 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  50.24 
 
 		 417 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  50.24 
 
 		 417 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  49.52 
 
 		 417 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  50 
 
 		 417 aa  424  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5056  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.28 
 
 		 431 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  49.76 
 
 		 417 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  49.76 
 
 		 417 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03190  NADH dehydrogenase subunit D  51.09 
 
 		 460 aa  423  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  51.2 
 
 		 417 aa  421  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  49.28 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  49.28 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  49.28 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  49.28 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  49.28 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1615  NADH dehydrogenase subunit D  50.12 
 
 		 417 aa  418  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0833647  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1601  NADH dehydrogenase subunit D  50.86 
 
 		 446 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  50.12 
 
 		 424 aa  419  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  49.28 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6679  NADH dehydrogenase subunit D  51.58 
 
 		 483 aa  421  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  51.2 
 
 		 417 aa  421  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1547  NADH dehydrogenase subunit D  50.86 
 
 		 446 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.795023  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1577  NADH dehydrogenase subunit D  50.86 
 
 		 446 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  49.28 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2006  NADH dehydrogenase subunit D  49.28 
 
 		 417 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000196393  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2692  NADH dehydrogenase subunit D  50.59 
 
 		 434 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4555  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.72 
 
 		 443 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  52.47 
 
 		 388 aa  417  9.999999999999999e-116  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2828  NADH dehydrogenase subunit D  48.32 
 
 		 435 aa  415  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0243  NADH dehydrogenase subunit D  47.09 
 
 		 435 aa  415  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0272  NADH dehydrogenase subunit D  47.09 
 
 		 435 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2027  NADH dehydrogenase subunit D  48.72 
 
 		 436 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127355  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  50.64 
 
 		 390 aa  414  1e-114  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0523  NADH dehydrogenase subunit D  50.74 
 
 		 446 aa  413  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  48.32 
 
 		 417 aa  412  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01290  NADH dehydrogenase subunit D  48.32 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191542  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  48.08 
 
 		 417 aa  412  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  48.8 
 
 		 417 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  48.17 
 
 		 792 aa  408  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  48.31 
 
 		 417 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  48.68 
 
 		 417 aa  411  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  48.08 
 
 		 417 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  48.32 
 
 		 417 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  48.56 
 
 		 417 aa  408  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  47.84 
 
 		 417 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  47.6 
 
 		 417 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  48.32 
 
 		 417 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2810  NADH dehydrogenase subunit D  48.8 
 
 		 417 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  50.39 
 
 		 393 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  48.8 
 
 		 417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  47.6 
 
 		 417 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  47.6 
 
 		 417 aa  403  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3171  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.61 
 
 		 426 aa  402  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  49.61 
 
 		 393 aa  402  1e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  47.96 
 
 		 417 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2562  NADH dehydrogenase subunit D  46.88 
 
 		 417 aa  404  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1882  NADH dehydrogenase subunit D  49.15 
 
 		 442 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.303191  normal  0.424323 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  47.58 
 
 		 417 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  47.43 
 
 		 791 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  49.36 
 
 		 416 aa  405  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3507  NADH dehydrogenase subunit D  46.88 
 
 		 417 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  47.58 
 
 		 417 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  47.58 
 
 		 417 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  48.34 
 
 		 397 aa  402  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  46.86 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>