114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3672 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3672  UspA domain-containing protein  100 
 
 
148 aa  292  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128034  decreased coverage  0.00271442 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1318  UspA domain-containing protein  92.48 
 
 
144 aa  228  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0138898  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  35.97 
 
 
910 aa  78.2  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0896  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  35.77 
 
 
658 aa  73.9  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000123785 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
888 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  35.96 
 
 
885 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4648  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
900 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 
892 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
889 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3227  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
890 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 
902 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1874  Osmosensitive K channel His kinase sensor  34.15 
 
 
895 aa  67  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.743469  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1080  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
902 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.987638  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0181  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 
905 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00652  fused sensory histidine kinase in two-component regulatory system with KdpE: signal sensing protein  35.04 
 
 
895 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2941  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
894 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00643  hypothetical protein  35.04 
 
 
894 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3779  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
912 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0742  sensor protein KdpD  35.04 
 
 
894 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0721  sensor protein KdpD  35.04 
 
 
894 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.594911  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0236  osmosensitive K channel His kinase sensor  37.41 
 
 
905 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2961  sensor protein KdpD  35.04 
 
 
895 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0717  sensor protein KdpD  35.04 
 
 
894 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.649763  normal  0.772603 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0788  sensor protein KdpD  35.04 
 
 
894 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0554  sensor protein KdpD  35.04 
 
 
894 aa  63.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2823  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 
901 aa  63.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1245  sensor protein KdpD  30 
 
 
897 aa  62  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.011545  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1971  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  31.9 
 
 
374 aa  61.6  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.195386  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0764  sensor protein KdpD  33.63 
 
 
894 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0825  sensor protein KdpD  33.63 
 
 
894 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0325382 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0861  sensor protein KdpD  33.63 
 
 
905 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0751  sensor protein KdpD  33.63 
 
 
894 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0811  sensor protein KdpD  33.63 
 
 
894 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00623216  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5839  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
902 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243698  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1127  sensor protein KdpD  33.06 
 
 
910 aa  62  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1667  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
897 aa  61.6  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2088  osmosensitive K channel signal transduction histidine kinase, sensor subunit KdpD  33.33 
 
 
384 aa  61.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.510085  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3236  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
900 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.734401  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2273  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
895 aa  60.5  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  34.82 
 
 
908 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3579  sensor protein KdpD  34.82 
 
 
908 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1156  sensor protein KdpD  34.82 
 
 
908 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.486498  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4547  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
907 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3089  hypothetical protein  25.81 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330807  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
905 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2617  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  33.63 
 
 
388 aa  58.9  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0827  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
892 aa  58.5  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.23395  normal  0.0418421 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
902 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2930  sensor protein KdpD  33.33 
 
 
909 aa  57.4  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.770189  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0381  osmosensitive K channel signal transduction histidine kinase, sensor subunit KdpD  29.13 
 
 
371 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000830427  normal  0.0448438 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2503  two-component regulatory protein sensor kinase  32.8 
 
 
906 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4719  Osmosensitive K channel His kinase sensor  29.82 
 
 
377 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
907 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 
887 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2991  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
894 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 
887 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1746  Osmosensitive K channel His kinase sensor  33.96 
 
 
553 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0720  Osmosensitive K channel His kinase sensor  33.33 
 
 
643 aa  56.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0117692  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1215  sensor protein KdpD  31.86 
 
 
915 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.693772  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6751  Osmosensitive K channel His kinase sensor  28.95 
 
 
902 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1158  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
897 aa  54.7  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 
907 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1207  sensor protein KdpD  32.32 
 
 
895 aa  54.7  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2535  UspA domain-containing protein  29.23 
 
 
351 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1465  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 
895 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.113581  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0190  osmosensitive K+ channel histidine kinase sensor subunit  25.44 
 
 
373 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921987  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0665  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  33.02 
 
 
907 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1213  sensor histidine kinase KdpD  29.03 
 
 
900 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6335  sensory histidine kinase in two-component regulatory system wtih KdpE, regulation of potassium translocation  31.3 
 
 
905 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0342372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2504  Osmosensitive K channel His kinase sensor  30.3 
 
 
376 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.272614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3385  two-component sensor kinase KDPD transcription regulator protein  31.68 
 
 
937 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0725  Osmosensitive K channel His kinase sensor  35.09 
 
 
391 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6071  two component sensor kinase  29.81 
 
 
902 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43350  two-component sensor KdpD  30.23 
 
 
885 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.619422  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3637  two-component sensor KdpD  30.23 
 
 
885 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2423  UspA domain protein  21.37 
 
 
127 aa  50.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1680  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 
961 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3612  osmosensitive K channel signal transduction histidine kinase, sensor subunit KdpD  28 
 
 
374 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.633235  hitchhiker  0.000277552 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0067  Osmosensitive K channel His kinase sensor  27.41 
 
 
374 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1986  sensor kinase for the kdp operon  27.59 
 
 
374 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169225  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1099  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
896 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2574  Osmosensitive K channel His kinase sensor  26.72 
 
 
375 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5921  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 
904 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3592  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
938 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10559  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4030  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 
883 aa  47  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3270  Osmosensitive K channel His kinase sensor  30.39 
 
 
938 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0289093  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2115  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 
885 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2153  osmosensitive K channel His kinase sensor  25.37 
 
 
885 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.226413  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4239  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 
894 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24520  osmosensory K+channel histidine protein kinase, KdpD  32.8 
 
 
874 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.889371  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0711  Osmosensitive K channel His kinase sensor  27.43 
 
 
368 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1884  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 
913 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0390049  normal  0.40253 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0684  Osmosensitive K channel His kinase sensor  27.43 
 
 
368 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2229  sensor histidine kinase KdpD  26.47 
 
 
913 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1175  osmosensitive K channel signal transduction histidine kinase, sensor subunit KdpD  33.33 
 
 
389 aa  45.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0056  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  25.21 
 
 
379 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0508  osmosensitive K+ channel, histidine kinase sensor  22.61 
 
 
373 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.831446  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0931  osmosensitive K+ channel histidine kinase-like protein  22.4 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5361  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 
897 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0303077 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1707  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
849 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480008 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>