45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3653 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3653  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  79.56 
 
 		 225 aa  305  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2745  protein of unknown function DUF218  26.57 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  28.57 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0692  hypothetical protein  31.33 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0213382  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  32.76 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  29.44 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1216  protein of unknown function DUF218  27.16 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000413314  decreased coverage  0.000114911 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  29.34 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  39.25 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  39.25 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  27.27 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  35.97 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  25 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  32.34 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  26.97 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  26.34 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  25.89 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  32.73 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3516  hypothetical protein  25 
 
 		 225 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  33.04 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  32.31 
 
 		 251 aa  49.7  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3513  hypothetical protein  24.86 
 
 		 225 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3269  hypothetical protein  24.04 
 
 		 251 aa  48.9  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.106822  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3299  hypothetical protein  24.04 
 
 		 251 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.23381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3559  hypothetical protein  24.04 
 
 		 225 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3524  hypothetical protein  23.73 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2846  hypothetical protein  28.57 
 
 		 280 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  31.29 
 
 		 300 aa  46.2  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  23.63 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2273  protein of unknown function DUF218  32.37 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1127  hypothetical protein  31.79 
 
 		 252 aa  45.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  25.27 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  23.91 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1691  hypothetical protein  33.56 
 
 		 204 aa  45.1  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0187033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  33.04 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  27.27 
 
 		 199 aa  44.7  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0483  hypothetical protein  33.86 
 
 		 259 aa  42.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  27.85 
 
 		 246 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  33.04 
 
 		 192 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  29.83 
 
 		 246 aa  41.6  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  25.99 
 
 		 198 aa  41.6  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  29.93 
 
 		 182 aa  41.2  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  29.93 
 
 		 182 aa  41.2  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>