35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3651 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3651  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  753    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0487  hypothetical protein  67.13 
 
 		 362 aa  503  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  30.51 
 
 		 348 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2342  hypothetical protein  24.65 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2634  hypothetical protein  30.15 
 
 		 377 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0584962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3308  hypothetical protein  30.74 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5378  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0503  hypothetical protein  20.18 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1528  hypothetical protein  27.49 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2330  hypothetical protein  26.35 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.210198 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00669  hypothetical protein  23.71 
 
 		 331 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0275  hypothetical protein  28.51 
 
 		 350 aa  67  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0390  hypothetical protein  27.45 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  32.08 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  26.02 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1138  hypothetical protein  26.25 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2976  hypothetical protein  26.16 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  24.66 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3120  hypothetical protein  26.16 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  27.07 
 
 		 354 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  26.79 
 
 		 366 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  28.21 
 
 		 340 aa  51.2  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  25.95 
 
 		 366 aa  49.3  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  26.8 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  25 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  28.31 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  25.73 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  26.67 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  25.45 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2728  protein of unknown function DUF482  23.61 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2348  hypothetical protein  38.89 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291454  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  25.73 
 
 		 346 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  30.3 
 
 		 384 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  26.94 
 
 		 363 aa  44.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  25.29 
 
 		 346 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>