More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3605 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  93.03 
 
 		 405 aa  758    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 405 aa  828    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0334  glycosyl transferase group 1  75.98 
 
 		 411 aa  555  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.145244 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  62.75 
 
 		 417 aa  522  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  46.82 
 
 		 409 aa  333  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  44.95 
 
 		 434 aa  323  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  44.9 
 
 		 394 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  45.15 
 
 		 393 aa  320  3e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  42.89 
 
 		 397 aa  315  6e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  44.02 
 
 		 394 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.9 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4414  glycosyl transferase, group 1  41.77 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63782  normal  0.431195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 		 445 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 421 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  24.26 
 
 		 394 aa  100  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 		 401 aa  97.8  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 419 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  23.78 
 
 		 416 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  27.63 
 
 		 386 aa  94.7  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2941  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  27.67 
 
 		 723 aa  91.3  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  28.24 
 
 		 404 aa  90.1  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 		 428 aa  90.1  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 		 481 aa  89.7  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 		 426 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  22.93 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  23.18 
 
 		 417 aa  82.8  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 		 348 aa  82.8  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6558  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 		 458 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 		 463 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  24.16 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30010  hypothetical protein  29.82 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255646  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  27.81 
 
 		 557 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 		 452 aa  76.3  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 		 419 aa  76.3  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  23.33 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 424 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  20.47 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  24.17 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  21.82 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26850  glycosyltransferase  26.99 
 
 		 573 aa  74.3  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1092  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  25.95 
 
 		 569 aa  73.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4476  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.361757 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 		 357 aa  72.8  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1085  glycosyl transferase, group 1  25.11 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4413  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  22.69 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  24.33 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  24.85 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  23.29 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  23.12 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1489  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113053  normal  0.618426 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  28.01 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.16 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  24.85 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  25.16 
 
 		 769 aa  70.1  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  21.01 
 
 		 536 aa  70.1  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  24.41 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 		 453 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  23.56 
 
 		 393 aa  69.7  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 		 391 aa  69.7  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  22.28 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>