More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3564 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  100 
 
 		 274 aa  535  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  75.75 
 
 		 271 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  61.89 
 
 		 271 aa  295  5e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  46.48 
 
 		 270 aa  226  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  47.2 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  48.62 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  52.94 
 
 		 292 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09850  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  53.56 
 
 		 308 aa  201  7e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0480584  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  49.23 
 
 		 293 aa  201  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  48.59 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  50.61 
 
 		 284 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  45.95 
 
 		 269 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  48.74 
 
 		 253 aa  192  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  46.27 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  43.5 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  47.95 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  43.41 
 
 		 259 aa  186  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  44.09 
 
 		 275 aa  185  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  44.71 
 
 		 266 aa  185  6e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  44.71 
 
 		 266 aa  185  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  44.71 
 
 		 266 aa  185  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  43.75 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  47.11 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  45.53 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  45.08 
 
 		 277 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  43.02 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  37.1 
 
 		 405 aa  182  7e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  42.25 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  42.28 
 
 		 264 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  43.02 
 
 		 262 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3877  ABC transporter related  48.63 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  43.58 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  40.31 
 
 		 260 aa  178  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  47.13 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  38.04 
 
 		 424 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  47.28 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  47.28 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  41.54 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  47.28 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2122  ABC transporter related protein  43.57 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19567  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  44.14 
 
 		 255 aa  176  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  45.02 
 
 		 255 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  44.53 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  46.56 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  42.97 
 
 		 261 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  40.55 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  38.76 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  41.02 
 
 		 414 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0077  ABC transporter related protein  50 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  41.41 
 
 		 424 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  36.4 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  40.32 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  42.41 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  37.8 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  40.15 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  40.84 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  40.47 
 
 		 490 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  40.6 
 
 		 269 aa  172  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  38.61 
 
 		 264 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2875  hemin importer ATP-binding subunit  49.01 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  46.25 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  45.17 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  41.91 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  41.7 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  33.73 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.54 
 
 		 265 aa  169  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  35.63 
 
 		 268 aa  170  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  41.9 
 
 		 290 aa  169  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  41.63 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  37.4 
 
 		 409 aa  169  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.37 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  43.51 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.31 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  39.38 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  40.62 
 
 		 490 aa  169  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1553  ABC transporter related  42.25 
 
 		 283 aa  168  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620794  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  33.73 
 
 		 266 aa  168  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1532  ABC transporter related  42.25 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439514  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  36.6 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  43.82 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  43.6 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2814  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  41.63 
 
 		 265 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204949  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  38.81 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  39.02 
 
 		 536 aa  166  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  40.24 
 
 		 272 aa  166  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  43.1 
 
 		 285 aa  165  6.9999999999999995e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  40.61 
 
 		 260 aa  165  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  42.8 
 
 		 264 aa  165  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  40.32 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  43.41 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1155  ABC transporter related  42.25 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1635  ABC transporter related  42.25 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0148634  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1610  ABC transporter related  42.25 
 
 		 282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116676 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1934  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.7 
 
 		 296 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0195526  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  42.08 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2080  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.7 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0934583  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1920  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components  43.7 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  38.71 
 
 		 307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  39.15 
 
 		 269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  39.44 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>