53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3535 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3535  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.907357  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1373  hypothetical protein  84.93 
 
 
73 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3608  hypothetical protein  68.49 
 
 
73 aa  99.8  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0279579  normal  0.399105 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0889  hypothetical protein  47.69 
 
 
70 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.93552e-23 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0155  hypothetical protein  44.78 
 
 
73 aa  61.6  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000254633  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1360  hypothetical protein  45.45 
 
 
74 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218176  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0719  hypothetical protein  38.96 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0753  hypothetical protein  37.14 
 
 
70 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2776  hypothetical protein  45.71 
 
 
69 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.331238  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3356  hypothetical protein  45.28 
 
 
70 aa  57.4  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000427569  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0929  hypothetical protein  40 
 
 
74 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0821  hypothetical protein  33.77 
 
 
80 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0176075  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1082  hypothetical protein  45.28 
 
 
70 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0085  hypothetical protein  47.06 
 
 
69 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1650  hypothetical protein  48.15 
 
 
70 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000012075  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4499  hypothetical protein  43.66 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118764 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0697  hypothetical protein  42.25 
 
 
66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000971992  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4553  hypothetical protein  42.25 
 
 
66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00126894  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4538  hypothetical protein  42.25 
 
 
66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4649  hypothetical protein  42.25 
 
 
66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000137782  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4163  hypothetical protein  42.25 
 
 
66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4152  hypothetical protein  42.25 
 
 
66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.120970000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4314  hypothetical protein  42.25 
 
 
66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0022719  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1390  hypothetical protein  42.86 
 
 
70 aa  54.7  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0192663  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3136  hypothetical protein  41.43 
 
 
66 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000286621  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4266  hypothetical protein  42.25 
 
 
66 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000396076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4504  hypothetical protein  40.85 
 
 
66 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000229476  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1945  hypothetical protein  44.44 
 
 
69 aa  54.3  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0255588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1664  hypothetical protein  36.76 
 
 
74 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81028  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0547  hypothetical protein  48.15 
 
 
69 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353499  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0921  hypothetical protein  46.48 
 
 
75 aa  50.4  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0215012  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2294  hypothetical protein  40.3 
 
 
66 aa  50.1  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.132721 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0153  hypothetical protein  43.28 
 
 
73 aa  49.7  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.769283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4440  hypothetical protein  39.19 
 
 
74 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0928  hypothetical protein  38.03 
 
 
68 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21910  hypothetical protein  36.36 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1491  hypothetical protein  56.76 
 
 
46 aa  47.4  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3504  hypothetical protein  38.81 
 
 
66 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2520  hypothetical protein  38.03 
 
 
68 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000165687  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1455  hypothetical protein  44.9 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00399997  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1532  hypothetical protein  29.41 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1630  hypothetical protein  39.53 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13840  hypothetical protein  51.22 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1609  hypothetical protein  42 
 
 
73 aa  46.2  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1795  hypothetical protein  45.83 
 
 
72 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000743692 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1328  hypothetical protein  55.26 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353374  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0251  hypothetical protein  32.86 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837242  hitchhiker  0.00453428 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06061  hypothetical protein  38.71 
 
 
67 aa  42.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.693871 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2317  hypothetical protein  34.33 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00433359  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1175  hypothetical protein  50 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3560  hypothetical protein  42.5 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0161833 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1031  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.288931 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3739  hypothetical protein  32.56 
 
 
71 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>