129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3477 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3477  glutamine amidotransferase  100 
 
 
250 aa  504  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.856737  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1484  glutamine amidotransferase  83.81 
 
 
270 aa  427  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3349  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  69.08 
 
 
248 aa  353  1e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2612  glutamine amidotransferase  65.84 
 
 
245 aa  339  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000419892  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2070  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  54.29 
 
 
248 aa  268  5e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0439  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  52.24 
 
 
248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2008  glutamine amidotransferase  53.06 
 
 
241 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0374573  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0007  glutamine amidotransferase  48.78 
 
 
243 aa  262  4e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1346  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  52.19 
 
 
254 aa  256  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213034  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1154  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  52.26 
 
 
243 aa  247  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1207  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  48.97 
 
 
243 aa  247  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000807553  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1393  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  48.56 
 
 
243 aa  246  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000283202  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0589  glutamine amidotransferase  53.94 
 
 
241 aa  243  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.188888  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0444  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  53.06 
 
 
243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0995  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  51.23 
 
 
246 aa  231  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal  0.046971 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1626  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  49.59 
 
 
238 aa  229  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3015  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  54.88 
 
 
249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0012  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  44.86 
 
 
251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0967  glutamine amidotransferase  43.03 
 
 
243 aa  211  5.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2170  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.53 
 
 
264 aa  211  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.586275  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2123  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.53 
 
 
264 aa  211  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1784  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  46.44 
 
 
237 aa  211  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000240979  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2307  glutamine amidotransferase  47.72 
 
 
240 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0042539  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3272  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  51.25 
 
 
242 aa  204  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4286  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  43.41 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2037  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  48.5 
 
 
254 aa  198  7e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000233635 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1558  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.15 
 
 
262 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115303 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4133  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  43.25 
 
 
270 aa  191  7e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.601486  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  44.44 
 
 
744 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1026  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  47.33 
 
 
255 aa  190  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1429  cobyric acid synthase, putative  42.15 
 
 
241 aa  187  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0449  glutamine amidotransferase  43.05 
 
 
235 aa  187  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1230  putative glutamine amidotransferase  44.14 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.102244  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1945  glutamine amidotransferase  40.91 
 
 
243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1979  glutamine amidotransferase  40.91 
 
 
243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0846367  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0077  CobB/CobQ-like protein  45.53 
 
 
264 aa  179  4.999999999999999e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405616 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0984  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  40.27 
 
 
218 aa  176  4e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559589  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1234  cobyric acid synthase  40.62 
 
 
262 aa  174  9e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1789  glutamine amidotransferase  40.25 
 
 
243 aa  174  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1600  glutamine amidotransferase  39.75 
 
 
244 aa  168  7e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0883  cobyric acid synthase, putative  39.48 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1207  cobyric acid synthase  41.56 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2713  hypothetical protein  40.44 
 
 
236 aa  151  8e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0649  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.32 
 
 
237 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4347  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  40.35 
 
 
236 aa  148  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0371298  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0914  glutamine amidotransferase-like protein  41.32 
 
 
238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154978  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1033  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  40 
 
 
235 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0469  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  39.43 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1783  glutamine amidotransferase  37.73 
 
 
227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000285682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4902  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  39.83 
 
 
238 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4991  glutamine amidotransferase  39.83 
 
 
238 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.29 
 
 
240 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.824669  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5270  glutamine amidotransferase  39.83 
 
 
238 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13745  cobyric acid synthase cobQ2  40.09 
 
 
231 aa  143  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.560943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5521  glutamine amidotransferase  39.09 
 
 
238 aa  142  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1290  glutamine amidotransferase  38.68 
 
 
238 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2660  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  39.75 
 
 
239 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3223  glutamine amidotransferase  40.77 
 
 
240 aa  138  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3449  glutamine amidotransferase  39.59 
 
 
240 aa  136  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4003  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.33 
 
 
245 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1705  glutamine amidotransferase  42.66 
 
 
272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192765  hitchhiker  0.00572744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6530  glutamine amidotransferase  38.33 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0283  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  37.85 
 
 
247 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.84 
 
 
235 aa  87.4  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45382  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  32.28 
 
 
501 aa  63.2  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0858  cobyric acid synthase CobQ  26.86 
 
 
465 aa  60.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.924146  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1326  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  26.05 
 
 
248 aa  56.6  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000536393  hitchhiker  0.000591695 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  34.07 
 
 
511 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  34.4 
 
 
494 aa  55.5  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  36.51 
 
 
494 aa  55.1  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3549  cobyric acid synthase  31.28 
 
 
516 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  31.58 
 
 
484 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  32.2 
 
 
490 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  30.59 
 
 
483 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0183  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.03 
 
 
458 aa  51.6  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.689135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  32.52 
 
 
787 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  33.57 
 
 
488 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  35.25 
 
 
776 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  35.25 
 
 
772 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  31.09 
 
 
505 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  30.59 
 
 
506 aa  51.2  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1012  cobyric acid synthase  32 
 
 
506 aa  50.1  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1471  cobyric acid synthase CobQ  35.2 
 
 
480 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129857 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2386  cobyric acid synthase  29.82 
 
 
524 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3285  cobyric acid synthase  29.82 
 
 
525 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.485856  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  34.48 
 
 
490 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  34.45 
 
 
532 aa  48.9  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  35.77 
 
 
492 aa  48.9  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1259  cobyric acid synthase  29.14 
 
 
509 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.326028  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2918  cobyric acid synthase  31.79 
 
 
525 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.182709 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  24.39 
 
 
492 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  29.6 
 
 
512 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  32.52 
 
 
483 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1457  cobyric acid synthase  23.17 
 
 
492 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  37.8 
 
 
500 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5190  cobyric acid synthase CobQ  37.8 
 
 
500 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.424958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  26.7 
 
 
485 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5212  cobyric acid synthase CobQ  26.82 
 
 
538 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2617  cobyric acid synthase  34.21 
 
 
486 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1066  cobyric acid synthase  32.28 
 
 
503 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.641596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>