More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3475 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
559 aa  1147    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  76.98 
 
 
554 aa  842    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  67.17 
 
 
547 aa  740    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  94.55 
 
 
554 aa  1083    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  43.35 
 
 
556 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  45.57 
 
 
510 aa  445  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  44.27 
 
 
514 aa  427  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  41.68 
 
 
510 aa  405  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  43.5 
 
 
545 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  41.6 
 
 
510 aa  370  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  38.6 
 
 
547 aa  355  8.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 
551 aa  347  4e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  36.51 
 
 
556 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  35.16 
 
 
563 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  35.05 
 
 
564 aa  322  9.999999999999999e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  40.26 
 
 
526 aa  319  7.999999999999999e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  36.8 
 
 
561 aa  316  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  35.06 
 
 
565 aa  316  7e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  36.81 
 
 
537 aa  310  5e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  36.86 
 
 
516 aa  309  9e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  38.45 
 
 
533 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  34.35 
 
 
518 aa  296  5e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  35.54 
 
 
555 aa  293  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  39.41 
 
 
532 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  39.22 
 
 
532 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  38.23 
 
 
536 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  35.66 
 
 
549 aa  280  5e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  37.45 
 
 
527 aa  277  4e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  35.69 
 
 
537 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  35.91 
 
 
547 aa  270  4e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  38.03 
 
 
535 aa  263  4e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  37.48 
 
 
536 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  38.59 
 
 
532 aa  263  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  35.39 
 
 
539 aa  259  7e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  36.35 
 
 
536 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  37.85 
 
 
535 aa  258  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  33.58 
 
 
530 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  35.09 
 
 
533 aa  253  8.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  36.04 
 
 
552 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  34.34 
 
 
524 aa  250  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  35.81 
 
 
530 aa  250  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 
530 aa  249  9e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  32.94 
 
 
527 aa  227  4e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  34.27 
 
 
529 aa  227  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  34 
 
 
523 aa  220  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  32.82 
 
 
545 aa  219  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 
534 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 
528 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 
536 aa  214  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 
531 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  31.6 
 
 
545 aa  189  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 
532 aa  188  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  41.36 
 
 
531 aa  186  8e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  41.69 
 
 
531 aa  186  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  41.02 
 
 
531 aa  186  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 
534 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 
530 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
530 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
530 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  27.26 
 
 
533 aa  172  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 
534 aa  172  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 
520 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  29.39 
 
 
521 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 
523 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 
526 aa  166  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  29.96 
 
 
528 aa  163  8.000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  28.52 
 
 
531 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 
519 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 
522 aa  160  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 
524 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 
520 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 
517 aa  158  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 
528 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  28.95 
 
 
548 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 
520 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 
520 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  29.67 
 
 
535 aa  148  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  29.22 
 
 
528 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 
531 aa  145  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 
560 aa  144  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  27.02 
 
 
536 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 
527 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 
474 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
481 aa  140  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  25.95 
 
 
476 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 
523 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 
523 aa  137  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 
474 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  29.54 
 
 
530 aa  136  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 
506 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 
531 aa  135  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  28.3 
 
 
470 aa  131  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  28.3 
 
 
472 aa  130  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 
487 aa  125  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 
484 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  28.89 
 
 
504 aa  123  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  28.73 
 
 
505 aa  120  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  25.99 
 
 
522 aa  117  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  27.4 
 
 
507 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 
580 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>