More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3464 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  100 
 
 
188 aa  375  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  72.73 
 
 
174 aa  249  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  46.01 
 
 
170 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  42.28 
 
 
165 aa  77.4  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  34.43 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  40 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3372  mutT/nudix family protein  29.01 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3045  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  29.01 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  36.89 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 
159 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  32.64 
 
 
151 aa  67  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  32.64 
 
 
151 aa  67  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  32.77 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0415  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  32.2 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  32.2 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3076  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  32.2 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  32.2 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  32.2 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  32.2 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 
209 aa  64.3  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  32.2 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  34.95 
 
 
153 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  33.08 
 
 
149 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3137  mutT/nudix family protein  27.69 
 
 
153 aa  63.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0554874  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  33.58 
 
 
149 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  33.08 
 
 
149 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 
160 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  31.93 
 
 
149 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 
153 aa  62.8  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3374  MutT/nudix family protein  29.41 
 
 
149 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00196022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  32.33 
 
 
149 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  36.2 
 
 
168 aa  62.4  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  33.98 
 
 
153 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  33.98 
 
 
153 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 
154 aa  61.6  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  33.98 
 
 
153 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 
162 aa  61.6  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  33.98 
 
 
153 aa  61.2  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  33.98 
 
 
153 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  33.98 
 
 
153 aa  61.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2371  mutT/nudix family protein  32.33 
 
 
149 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0511564  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  33.98 
 
 
153 aa  61.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3145  ADP-ribose pyrophosphatase  33.94 
 
 
251 aa  61.2  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.087939  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  34.95 
 
 
229 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 
154 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 
158 aa  60.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
158 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3370  MutT/nudix family protein  27.13 
 
 
149 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312506  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0685  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
218 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2105  mutT/nudix family protein  33.6 
 
 
140 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
157 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 
136 aa  60.1  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 
228 aa  59.7  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  34.82 
 
 
145 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3352  phosphohydrolase  27.34 
 
 
148 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  33.66 
 
 
166 aa  59.3  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 
163 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
153 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  31.78 
 
 
152 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  32.45 
 
 
161 aa  59.3  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  38.02 
 
 
132 aa  58.9  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  32.09 
 
 
149 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  31.78 
 
 
154 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  31.82 
 
 
137 aa  58.2  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 
175 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  32.43 
 
 
137 aa  57.8  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  34.33 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
184 aa  57  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 
135 aa  57.4  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
135 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
150 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1385  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 
209 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1879  mutT/nudix family protein  27.73 
 
 
149 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 
154 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  33.93 
 
 
145 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  31.25 
 
 
136 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  31.25 
 
 
136 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  31.25 
 
 
136 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  33.09 
 
 
212 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
134 aa  55.5  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  29.32 
 
 
154 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0465  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 
137 aa  55.1  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  27.89 
 
 
164 aa  55.1  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 
146 aa  55.1  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3733  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  31.08 
 
 
150 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0829824  normal  0.0242018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
133 aa  55.1  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 
150 aa  54.7  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 
151 aa  54.7  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>